More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1273 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1273  putative branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 244 aa  480  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1095  branched-chain amino acid aminotransferase, putative  95.9 
 
 		 244 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0167966  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  31.91 
 
 		 271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2216  aminotransferase class IV  31.17 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.556361  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  24.5 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0616  aminotransferase, class IV  30.14 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.27072  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  30.12 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  28.05 
 
 		 298 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0610  aminotransferase class IV  31.72 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0570431  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4200  aminotransferase class IV  27.31 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.108763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  30.36 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 		 281 aa  95.9  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  29.63 
 
 		 295 aa  95.1  8e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  25.61 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.15 
 
 		 290 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  25 
 
 		 282 aa  92.4  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  25.29 
 
 		 280 aa  92.4  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2300  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.85 
 
 		 268 aa  92  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187606  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 		 298 aa  92  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  28.28 
 
 		 271 aa  92  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 		 298 aa  91.7  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 		 298 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  28.28 
 
 		 271 aa  91.7  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 		 298 aa  91.7  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 		 298 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1683  Para-aminobenzoate synthase, component I  29.7 
 
 		 615 aa  90.9  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  27.57 
 
 		 298 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  26.86 
 
 		 298 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4262  hypothetical protein  30.32 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  26.86 
 
 		 298 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  26.86 
 
 		 298 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  26.86 
 
 		 298 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4024  aminotransferase, class IV  25.88 
 
 		 285 aa  90.1  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  27.87 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  28.89 
 
 		 710 aa  89.4  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  27.78 
 
 		 269 aa  89  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  26.4 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  28.48 
 
 		 296 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0079  hypothetical protein  29.26 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1339  aminotransferase class IV  28.38 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1611  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.75 
 
 		 271 aa  86.3  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  28.57 
 
 		 618 aa  86.3  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  26.16 
 
 		 287 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  25.1 
 
 		 292 aa  85.1  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.28 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.69 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1911  4-amino-4-deoxychorismate lyase, putative  25.83 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.129492  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  25.1 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1586  aminodeoxychorismate lyase  25.83 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0753996 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0074  hypothetical protein  28.88 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.46 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  23.38 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  26.25 
 
 		 293 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  31.19 
 
 		 607 aa  81.6  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  27.35 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.16 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  26.92 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.27 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.61 
 
 		 601 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  24.57 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  27.98 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  25.88 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  26.72 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  26.36 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  27.27 
 
 		 274 aa  78.6  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  25.21 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  24.7 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  27.87 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  28.89 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  24.9 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  23.05 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  31.67 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  26.69 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  27.46 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2604  aminotransferase class IV  26.42 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.946338  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.66 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5238  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.64 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127403 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  25.21 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  26.03 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  22.26 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0068  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.43 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0051  aminotransferase class IV  25.97 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  26.69 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4377  aminotransferase class IV  25.11 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.505275  normal  0.583274 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.64 
 
 		 290 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1581  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.53 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  26.69 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1475  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.3 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000862113  hitchhiker  0.00000000000021335 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.75 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  26.32 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  24.51 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.75 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1217  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.98 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  24.44 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  26.32 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  30.93 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.18 
 
 		 615 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1139  aminotransferase class IV  26.16 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.092565  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  31.09 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  29.44 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>