More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1920 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1920  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
305 aa  620  1e-177  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.130955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2300  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.2 
 
 
268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187606  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.52 
 
 
270 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2615  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.71 
 
 
269 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  34.87 
 
 
269 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1998  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.45 
 
 
276 aa  126  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1545  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  37.7 
 
 
268 aa  125  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.185803  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  34.03 
 
 
269 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1764  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  34.03 
 
 
269 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  37.34 
 
 
288 aa  124  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1890  aminodeoxychorismate lyase  32.79 
 
 
269 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.08 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  32.65 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2454  aminotransferase class IV  32.79 
 
 
269 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00581034  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3829  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.25 
 
 
271 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2461  aminotransferase, class IV  32.24 
 
 
269 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000415666  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2574  aminodeoxychorismate lyase  32.24 
 
 
269 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.0405986 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2045  aminodeoxychorismate lyase  32.8 
 
 
296 aa  119  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  32.49 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2500  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.48 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00140105  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1418  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  36.44 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.711679 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1604  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  35.98 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0300662  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1274  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.82 
 
 
269 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131481  normal  0.593552 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1864  aminodeoxychorismate lyase  33.99 
 
 
272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.358986  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02332  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.87 
 
 
282 aa  112  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2804  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.62 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00411818  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  28.27 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2119  aminotransferase, class IV  32.23 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00194364  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2216  aminotransferase, class IV  31.36 
 
 
269 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14950  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.75 
 
 
271 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1650  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.02 
 
 
271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159709  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1502  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  30.77 
 
 
271 aa  109  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0156373  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  34.68 
 
 
310 aa  109  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1528  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.62 
 
 
271 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.36 
 
 
277 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1092  aminotransferase, class IV  32.1 
 
 
278 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2053  aminotransferase, class IV  29.83 
 
 
294 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3797  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.33 
 
 
271 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172255  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.56 
 
 
271 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1917  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.33 
 
 
271 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307364  unclonable  0.000000254306 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  33.05 
 
 
266 aa  105  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25710  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.98 
 
 
271 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0077515  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1626  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.96 
 
 
267 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1911  4-amino-4-deoxychorismate lyase, putative  34.57 
 
 
277 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.129492  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2269  aminotransferase class IV  28.95 
 
 
275 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.4966  normal  0.194503 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1586  aminodeoxychorismate lyase  34.57 
 
 
277 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0753996 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002999  aminodeoxychorismate lyase  32.62 
 
 
271 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0085011  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2242  aminotransferase, class IV  29.27 
 
 
277 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4154  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.86 
 
 
271 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0929284  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02905  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.9 
 
 
271 aa  102  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1493  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.76 
 
 
271 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0716  aminotransferase, class IV  27.72 
 
 
295 aa  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0327665  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  28.36 
 
 
298 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1255  aminodeoxychorismate lyase  36.32 
 
 
269 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489867  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2650  aminotransferase, class IV  31.43 
 
 
271 aa  99.4  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1909  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.22 
 
 
265 aa  99  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  decreased coverage  0.000000690882 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.64 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2243  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.74 
 
 
268 aa  99  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000604374  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  32.92 
 
 
269 aa  95.5  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3495  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.28 
 
 
268 aa  95.1  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429214  hitchhiker  0.00824664 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1312  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.0000000000000833328 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1297  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31 
 
 
269 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0225014  hitchhiker  1.45704e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2171  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31 
 
 
269 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  decreased coverage  0.000000000000025967 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  30.43 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1581  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.23 
 
 
268 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1988  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31 
 
 
269 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000218178  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1364  Aminodeoxychorismate lyase  30.56 
 
 
307 aa  94  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4200  aminotransferase class IV  33.47 
 
 
255 aa  93.6  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.108763  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  31.2 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1689  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.45 
 
 
268 aa  90.1  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00992906  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1921  aminodeoxychorismate lyase  26.84 
 
 
300 aa  89.7  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1611  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.95 
 
 
271 aa  89.7  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  28.09 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  29.83 
 
 
264 aa  88.2  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  25.69 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  26.36 
 
 
299 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  29.29 
 
 
288 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  26.36 
 
 
299 aa  87  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  26.36 
 
 
299 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  26.36 
 
 
299 aa  86.7  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  26.36 
 
 
299 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  26.36 
 
 
299 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  26.36 
 
 
299 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  28.05 
 
 
282 aa  86.3  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  26.36 
 
 
299 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  26.36 
 
 
299 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  28 
 
 
261 aa  85.5  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  25.67 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2898  aminotransferase, class IV  29.55 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.051905 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2031  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.39 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000010849  hitchhiker  0.00000935135 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  26.07 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  24.18 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  31.38 
 
 
280 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  24.18 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  24.18 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  24.18 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  24.18 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  24.54 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2228  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.35 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000140571  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  24.54 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>