More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1581 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1581  4-amino-4-deoxychorismate lyase  100 
 
 
268 aa  551  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3495  4-amino-4-deoxychorismate lyase  97.39 
 
 
268 aa  512  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429214  hitchhiker  0.00824664 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1689  4-amino-4-deoxychorismate lyase  96.64 
 
 
268 aa  507  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00992906  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  62.26 
 
 
267 aa  351  8.999999999999999e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2804  4-amino-4-deoxychorismate lyase  61.89 
 
 
265 aa  349  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00411818  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2500  4-amino-4-deoxychorismate lyase  61.89 
 
 
265 aa  348  7e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00140105  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1626  4-amino-4-deoxychorismate lyase  61.51 
 
 
267 aa  345  4e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1909  4-amino-4-deoxychorismate lyase  61.13 
 
 
265 aa  341  7e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  decreased coverage  0.000000690882 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1297  4-amino-4-deoxychorismate lyase  56.6 
 
 
269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0225014  hitchhiker  1.45704e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1274  4-amino-4-deoxychorismate lyase  54.34 
 
 
269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131481  normal  0.593552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1988  4-amino-4-deoxychorismate lyase  56.23 
 
 
269 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000218178  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2171  4-amino-4-deoxychorismate lyase  56.23 
 
 
269 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  decreased coverage  0.000000000000025967 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1312  4-amino-4-deoxychorismate lyase  55.85 
 
 
269 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.0000000000000833328 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1475  4-amino-4-deoxychorismate lyase  56.23 
 
 
269 aa  295  4e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000862113  hitchhiker  0.00000000000021335 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1217  4-amino-4-deoxychorismate lyase  55.47 
 
 
269 aa  292  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222751  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01092  4-amino-4-deoxychorismate lyase  55.09 
 
 
269 aa  290  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2551  aminodeoxychorismate lyase  55.85 
 
 
269 aa  290  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103186  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1218  4-amino-4-deoxychorismate lyase  55.09 
 
 
269 aa  290  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2505  4-amino-4-deoxychorismate lyase  55.09 
 
 
269 aa  290  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018668  unclonable  0.0000000105414 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01100  hypothetical protein  55.09 
 
 
269 aa  290  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000707213  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2031  4-amino-4-deoxychorismate lyase  55.47 
 
 
269 aa  289  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000010849  hitchhiker  0.00000935135 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2228  4-amino-4-deoxychorismate lyase  55.09 
 
 
269 aa  287  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000140571  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1611  4-amino-4-deoxychorismate lyase  57.36 
 
 
271 aa  282  4.0000000000000003e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0432  4-amino-4-deoxychorismate lyase  47.92 
 
 
267 aa  263  3e-69  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2119  aminotransferase, class IV  45.08 
 
 
271 aa  227  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00194364  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2243  4-amino-4-deoxychorismate lyase  41.25 
 
 
268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000604374  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02905  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.75 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  39.47 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.96 
 
 
277 aa  194  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002999  aminodeoxychorismate lyase  37.65 
 
 
271 aa  193  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0085011  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2300  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.06 
 
 
268 aa  188  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187606  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1092  aminotransferase, class IV  38.26 
 
 
278 aa  188  9e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  37.84 
 
 
271 aa  185  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  39.61 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2216  aminotransferase, class IV  37.7 
 
 
269 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  38.11 
 
 
269 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2615  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.15 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  37.3 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1890  aminodeoxychorismate lyase  36.48 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1764  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  36.48 
 
 
269 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2461  aminotransferase, class IV  36.07 
 
 
269 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000415666  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2454  aminotransferase class IV  35.66 
 
 
269 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00581034  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2574  aminodeoxychorismate lyase  36.07 
 
 
269 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.0405986 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2242  aminotransferase, class IV  36.23 
 
 
277 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.59 
 
 
271 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2053  aminotransferase, class IV  37.76 
 
 
294 aa  159  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1418  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  40.32 
 
 
285 aa  158  9e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.711679 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2045  aminodeoxychorismate lyase  38.87 
 
 
296 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1502  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  39.66 
 
 
271 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0156373  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1528  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.78 
 
 
271 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2650  aminotransferase, class IV  36.19 
 
 
271 aa  152  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2269  aminotransferase class IV  38.43 
 
 
275 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.4966  normal  0.194503 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02332  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.19 
 
 
282 aa  151  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3829  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.25 
 
 
271 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4154  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.21 
 
 
271 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0929284  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1650  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.12 
 
 
271 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159709  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1493  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.1 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.61 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  37.55 
 
 
288 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1998  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.8 
 
 
276 aa  143  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1921  aminodeoxychorismate lyase  31.73 
 
 
300 aa  142  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25710  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.23 
 
 
271 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0077515  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1917  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.88 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307364  unclonable  0.000000254306 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3797  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.88 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172255  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14950  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.88 
 
 
271 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.26 
 
 
270 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1586  aminodeoxychorismate lyase  35.34 
 
 
277 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0753996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1911  4-amino-4-deoxychorismate lyase, putative  35.34 
 
 
277 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.129492  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1545  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  33.59 
 
 
268 aa  128  9.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.185803  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0716  aminotransferase, class IV  32.66 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0327665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1604  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  33.05 
 
 
271 aa  122  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0300662  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1255  aminodeoxychorismate lyase  33.2 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489867  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  30.08 
 
 
298 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1864  aminodeoxychorismate lyase  32.94 
 
 
272 aa  102  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.358986  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1920  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
305 aa  102  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.130955  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1632  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  33.02 
 
 
289 aa  98.2  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.114958  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  27.87 
 
 
293 aa  95.9  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  30.71 
 
 
266 aa  95.9  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0141  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  26.42 
 
 
319 aa  95.5  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.186701  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  33.01 
 
 
264 aa  95.5  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  25.71 
 
 
281 aa  94.7  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0121  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase-like protein  31.73 
 
 
326 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0823171  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  29.73 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3708  aminotransferase, class IV  30.89 
 
 
288 aa  94.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464528  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  25.31 
 
 
287 aa  92.4  7e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  26.79 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  27.49 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  26.53 
 
 
291 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  28.02 
 
 
299 aa  90.5  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  27.76 
 
 
271 aa  90.1  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  28.92 
 
 
277 aa  89.7  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  28.96 
 
 
299 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  28.96 
 
 
299 aa  89.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  29.23 
 
 
303 aa  89.4  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  26.12 
 
 
291 aa  89  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  26.53 
 
 
291 aa  89  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  29.32 
 
 
291 aa  89  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  26.12 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  26.12 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>