More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3708 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3708  aminotransferase, class IV  100 
 
 		 288 aa  574  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  32.56 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  35.69 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.36 
 
 		 741 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 289 aa  125  9e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.66 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  31.78 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.58 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  33.08 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  30.71 
 
 		 288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 303 aa  118  9e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  34.9 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  32.97 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  35.07 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  31.32 
 
 		 287 aa  116  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  33.47 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  34.85 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  31.43 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  31.41 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  32 
 
 		 300 aa  113  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  33.06 
 
 		 287 aa  112  6e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  32.56 
 
 		 291 aa  112  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  28.91 
 
 		 291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  33.08 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2699  aminotransferase class IV  28.99 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  35.61 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2898  aminotransferase, class IV  36.05 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.051905 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  34.48 
 
 		 285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  33.85 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.98 
 
 		 285 aa  109  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  35.62 
 
 		 295 aa  109  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  31.73 
 
 		 282 aa  108  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  37.88 
 
 		 296 aa  108  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  34.48 
 
 		 295 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  32.02 
 
 		 347 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.47 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  32.43 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  30.27 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  32.56 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  32.81 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5244  aminotransferase class IV  29.96 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  36.32 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  31.43 
 
 		 286 aa  106  6e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  31.52 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  29.69 
 
 		 293 aa  105  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4206  aminotransferase class IV  30.08 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  33.07 
 
 		 288 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  29.92 
 
 		 299 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.68 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  29.8 
 
 		 299 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  30.04 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  29.92 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  29.92 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  33.2 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  30.53 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  29.55 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  32.85 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  29.55 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  30.68 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  29.55 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  29.55 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  29.55 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  29.55 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  29.55 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  29.46 
 
 		 304 aa  102  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  34.29 
 
 		 261 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  30.68 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  30.68 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  30.68 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  30.68 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  30.68 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  30.68 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  36.58 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  33.72 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  30.15 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  30.68 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  30.68 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  32.02 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  31.09 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  28.68 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4024  aminotransferase, class IV  28.03 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2140  branched-chain amino acid aminotransferase  31.58 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  28.16 
 
 		 293 aa  99.8  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.96 
 
 		 290 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  30.28 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  34.1 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2653  aminotransferase, class IV  30.41 
 
 		 299 aa  99.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0838817  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36 
 
 		 288 aa  99.4  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01083  D-alanine transaminase  29.02 
 
 		 288 aa  99  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  29.15 
 
 		 303 aa  99  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02905  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.84 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  30.5 
 
 		 287 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.17 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5238  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.92 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127403 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  30.34 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  36.09 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  32.7 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  34.22 
 
 		 311 aa  96.3  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>