More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2699 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2699  aminotransferase class IV  100 
 
 		 305 aa  632  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5244  aminotransferase class IV  67.68 
 
 		 317 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4206  aminotransferase class IV  47.83 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2852  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  45.95 
 
 		 308 aa  279  3e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1215  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  47.77 
 
 		 299 aa  265  7e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2876  aminotransferase, class IV  47.42 
 
 		 299 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2653  aminotransferase, class IV  46.39 
 
 		 299 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0838817  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50806  predicted protein  37.21 
 
 		 588 aa  216  4e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  41.22 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  39.47 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  39.26 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  38.87 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  36.17 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  36.04 
 
 		 286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  37.91 
 
 		 291 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  37.14 
 
 		 292 aa  179  8e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  38.41 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  38.02 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  35.13 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  34.77 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  34.77 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  34.77 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  34.77 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  34.77 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  34.77 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  34.77 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  34.41 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  34.77 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  34.17 
 
 		 288 aa  171  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  34.77 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  36.78 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  35.34 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  34.86 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  35 
 
 		 286 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  34.64 
 
 		 287 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  35.29 
 
 		 289 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  34.29 
 
 		 292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  34.63 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  37.21 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  36.29 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  35.91 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  35.91 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  35.91 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  34.73 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  35.91 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  35.91 
 
 		 298 aa  162  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  35.91 
 
 		 298 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  37.41 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  35.91 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  35.91 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  36.69 
 
 		 293 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  35.52 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  31.23 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  34.91 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  34.75 
 
 		 299 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  35.56 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  34.28 
 
 		 288 aa  157  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  33.98 
 
 		 299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  34.04 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  32.37 
 
 		 347 aa  150  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 		 307 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 		 307 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  33.56 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  34.46 
 
 		 306 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  32.07 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  33.56 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.69 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  33.1 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.97 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  30.9 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4955  aminotransferase class IV  32.04 
 
 		 496 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111871 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  32.3 
 
 		 306 aa  129  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3053  aminotransferase, class IV  31.69 
 
 		 496 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  29.07 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5314  aminotransferase, class IV  31.69 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  33.11 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  32.3 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.13 
 
 		 290 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  31.14 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  30.45 
 
 		 303 aa  124  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  31.25 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.13 
 
 		 290 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  32.36 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  31.83 
 
 		 307 aa  122  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  33.22 
 
 		 310 aa  122  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.13 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  31.47 
 
 		 307 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  32.31 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  30.03 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  32.31 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  30.77 
 
 		 307 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  29.55 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.88 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  29.25 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  32.99 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  31.12 
 
 		 307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5238  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.67 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127403 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  31.12 
 
 		 307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  30.66 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  30.07 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>