More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5244 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5244  aminotransferase class IV  100 
 
 		 317 aa  651    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2699  aminotransferase class IV  67.68 
 
 		 305 aa  421  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1215  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  52.35 
 
 		 299 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2876  aminotransferase, class IV  52.35 
 
 		 299 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2653  aminotransferase, class IV  48.66 
 
 		 299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0838817  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4206  aminotransferase class IV  46.46 
 
 		 307 aa  269  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2852  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  47.22 
 
 		 308 aa  265  8e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50806  predicted protein  38.87 
 
 		 588 aa  223  3e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  44.29 
 
 		 291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  41.01 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  41.75 
 
 		 292 aa  202  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  41.11 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  41.84 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  39.21 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  41.2 
 
 		 293 aa  199  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  38.24 
 
 		 292 aa  197  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  38.43 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  39.78 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  42.03 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  39.21 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  37.72 
 
 		 286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  38.08 
 
 		 287 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  38.49 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  38.13 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  38.13 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  38.13 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  38.13 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  38.49 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  38.13 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  37.45 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  38.13 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  38.13 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  38.13 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  37.77 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  36.97 
 
 		 292 aa  186  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  37.41 
 
 		 286 aa  181  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  37.89 
 
 		 295 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  37.83 
 
 		 299 aa  179  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  35.48 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 		 303 aa  177  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  39.64 
 
 		 288 aa  176  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  35.06 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  35.61 
 
 		 288 aa  173  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  34.18 
 
 		 288 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  36.71 
 
 		 298 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  38.16 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  36.49 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  36.36 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  36.36 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  36.49 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  36.36 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  36.49 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  36.36 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  36.36 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  36.49 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  35.97 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  35.94 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  32.87 
 
 		 347 aa  166  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  35.21 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  36.17 
 
 		 282 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  33.89 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  34.35 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  32.44 
 
 		 307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  32.44 
 
 		 307 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  32.88 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2359  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  32.77 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.74058  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  31.6 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  33.45 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4955  aminotransferase class IV  30.95 
 
 		 496 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111871 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  33.56 
 
 		 306 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  30.22 
 
 		 319 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3053  aminotransferase, class IV  30.95 
 
 		 496 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  32.86 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5314  aminotransferase, class IV  30.95 
 
 		 317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  30.5 
 
 		 307 aa  129  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  31.08 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  30.03 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  32.18 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0041  branched-chain amino acid aminotransferase  31.7 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  33.56 
 
 		 291 aa  126  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  29.55 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  33.21 
 
 		 284 aa  125  9e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  30.21 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  31.96 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  32.98 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0461  aminotransferase, class IV  29.55 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  30.5 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  31.4 
 
 		 307 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  31.4 
 
 		 307 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1364  Aminodeoxychorismate lyase  31.82 
 
 		 307 aa  122  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2654  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  31.86 
 
 		 307 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.97 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  31.4 
 
 		 306 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.66 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  30.72 
 
 		 306 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.31 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.69 
 
 		 285 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  30.41 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  33.33 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>