More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0461 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0461  aminotransferase, class IV  100 
 
 		 301 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4955  aminotransferase class IV  53.85 
 
 		 496 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5314  aminotransferase, class IV  53.85 
 
 		 317 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3053  aminotransferase, class IV  53.85 
 
 		 496 aa  335  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1122  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  47.14 
 
 		 299 aa  266  2.9999999999999995e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0838253  normal  0.233967 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6784  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  42.03 
 
 		 326 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4516  aminotransferase, class IV  40.28 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108698  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  31.41 
 
 		 292 aa  159  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  30.63 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  28.78 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  29.14 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  31.05 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  26.81 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  29.01 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  29.6 
 
 		 289 aa  143  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  29.39 
 
 		 347 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  28.62 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  28.37 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  27.78 
 
 		 288 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2654  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  34.01 
 
 		 307 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2839  aminotransferase class IV  34.84 
 
 		 307 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0464301  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  27.34 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  27.54 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  32.3 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  27.37 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  27.18 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2744  aminotransferase class IV  34.49 
 
 		 307 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  27.08 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 		 299 aa  135  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  27.14 
 
 		 299 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  28.37 
 
 		 290 aa  135  8e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  24.65 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  28.11 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  33.8 
 
 		 298 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  27.05 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  27.64 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  27.64 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  26.79 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  27.64 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  26.91 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  27.64 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  27.64 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  26.99 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  26.99 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  26.99 
 
 		 298 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  26.99 
 
 		 298 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 		 299 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  33.57 
 
 		 291 aa  129  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 		 299 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  27.64 
 
 		 298 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  26.91 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  26.91 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  26.84 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  32.62 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  25.74 
 
 		 287 aa  126  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  24.36 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  31.4 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  25.09 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5244  aminotransferase class IV  29.55 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  25.71 
 
 		 299 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0248  branched-chain amino acid aminotransferase  30.16 
 
 		 305 aa  122  9e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  26.18 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  31.45 
 
 		 311 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  31.79 
 
 		 283 aa  119  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1366  branched-chain amino acid aminotransferase  28.14 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  28.08 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  28.62 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  29.25 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  28.07 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  29.76 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  30.83 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  32.19 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  29.55 
 
 		 286 aa  116  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  27.3 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  28.82 
 
 		 308 aa  115  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2699  aminotransferase class IV  27.4 
 
 		 305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  30.04 
 
 		 286 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  28.62 
 
 		 286 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  29.75 
 
 		 306 aa  115  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  29.82 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  32.3 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  26.53 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  29.47 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  30.98 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50806  predicted protein  27.02 
 
 		 588 aa  112  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.62 
 
 		 288 aa  112  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0381  D-amino acid aminotransferase  30.64 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2544  branched-chain amino acid aminotransferase  28.66 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.0975839 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1370  D-amino acid aminotransferase  32.06 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0057  D-amino acid aminotransferase  32.06 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0621  D-amino acid aminotransferase  32.06 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  26.57 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0223  D-amino acid aminotransferase  32.06 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>