More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6784 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6784  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  100 
 
 
326 aa  681    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0461  aminotransferase, class IV  42.03 
 
 
301 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4955  aminotransferase class IV  38.18 
 
 
496 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0111871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3053  aminotransferase, class IV  38.18 
 
 
496 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5314  aminotransferase, class IV  38.18 
 
 
317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1122  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.06 
 
 
299 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0838253  normal  0.233967 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4516  aminotransferase, class IV  31.45 
 
 
337 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108698  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  29.89 
 
 
295 aa  142  9e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  29.3 
 
 
288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  29.43 
 
 
291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  31.32 
 
 
292 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  28.67 
 
 
282 aa  135  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  28.93 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  27.86 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  29.75 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  30.07 
 
 
295 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 
292 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  30.15 
 
 
288 aa  132  9e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  30.18 
 
 
289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  28.67 
 
 
293 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  27.7 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  28.57 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  30.25 
 
 
297 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  29.09 
 
 
347 aa  126  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  29.37 
 
 
298 aa  126  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  32.5 
 
 
300 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  31.9 
 
 
291 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  28 
 
 
293 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  29 
 
 
298 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  29 
 
 
298 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  29 
 
 
298 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  28.62 
 
 
298 aa  123  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  29 
 
 
298 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  28.62 
 
 
298 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  28.62 
 
 
298 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  28.62 
 
 
298 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  28.62 
 
 
298 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 
292 aa  122  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  28.16 
 
 
288 aa  122  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  31.25 
 
 
311 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.07 
 
 
291 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  26.88 
 
 
299 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  31.36 
 
 
306 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  27.94 
 
 
292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  26.95 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  26.95 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  27.3 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  26.95 
 
 
287 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2699  aminotransferase class IV  26.67 
 
 
305 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  28.26 
 
 
299 aa  116  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  29.28 
 
 
290 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  28.26 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  28.26 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  28.26 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  28.26 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  28.26 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  28.26 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  28.26 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  28.26 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  26.44 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  29.97 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  28.26 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1364  Aminodeoxychorismate lyase  27.74 
 
 
307 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  31.03 
 
 
285 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  29.28 
 
 
306 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  28.57 
 
 
291 aa  114  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  31.03 
 
 
285 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  28.4 
 
 
311 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  29.73 
 
 
310 aa  113  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  28.12 
 
 
309 aa  112  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 
299 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  29.39 
 
 
286 aa  112  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  26.18 
 
 
299 aa  112  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  31.36 
 
 
294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  30 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  31.23 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5244  aminotransferase class IV  28.42 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2654  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  29.53 
 
 
307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.07 
 
 
290 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  30.72 
 
 
290 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  30.16 
 
 
307 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  26.6 
 
 
286 aa  110  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  28.72 
 
 
266 aa  110  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  30.72 
 
 
290 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  28.89 
 
 
282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  29.62 
 
 
306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  31.79 
 
 
285 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  27.43 
 
 
307 aa  109  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50806  predicted protein  28.47 
 
 
588 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  30.25 
 
 
284 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  28.33 
 
 
295 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  27.93 
 
 
286 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  29.61 
 
 
305 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  29.62 
 
 
306 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  27.78 
 
 
307 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  28.62 
 
 
306 aa  106  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  27.78 
 
 
307 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2744  aminotransferase class IV  29.69 
 
 
307 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  26.92 
 
 
284 aa  106  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0412  aminotransferase class IV  29.21 
 
 
308 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11828  normal  0.0157009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>