More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4206 on replicon NC_009959
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009959  Dshi_4206  aminotransferase class IV  100 
 
 		 307 aa  642    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2852  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  86.09 
 
 		 308 aa  555  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1215  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  69.46 
 
 		 299 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2876  aminotransferase, class IV  69.46 
 
 		 299 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2653  aminotransferase, class IV  68.14 
 
 		 299 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0838817  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2699  aminotransferase class IV  47.83 
 
 		 305 aa  290  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5244  aminotransferase class IV  46.46 
 
 		 317 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50806  predicted protein  39.6 
 
 		 588 aa  198  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  34.51 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  35.66 
 
 		 299 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  33.57 
 
 		 292 aa  172  9e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  34.89 
 
 		 297 aa  169  7e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  35.29 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  33.8 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  35.56 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  36.01 
 
 		 292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  34.6 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  34.6 
 
 		 299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  34.26 
 
 		 299 aa  165  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  34.26 
 
 		 299 aa  165  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  34.26 
 
 		 299 aa  165  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  34.26 
 
 		 299 aa  165  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  34.26 
 
 		 299 aa  165  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  34.26 
 
 		 299 aa  165  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  34.26 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  34.15 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  35.07 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  32.96 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  32.86 
 
 		 289 aa  159  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  36.52 
 
 		 310 aa  159  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 293 aa  158  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  34.26 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  35.44 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  31.83 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  32.51 
 
 		 288 aa  157  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  34.17 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  31.82 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  31.82 
 
 		 287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  31.82 
 
 		 287 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  31.47 
 
 		 287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  32.71 
 
 		 286 aa  155  6e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  30.82 
 
 		 297 aa  155  8e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  32.87 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  32.34 
 
 		 299 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  32.21 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  31.67 
 
 		 347 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  34.21 
 
 		 293 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  35.74 
 
 		 311 aa  142  9e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  31.69 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  31.69 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  31.69 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  31.69 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  33.83 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  31.69 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  31.34 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  31.69 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  31.69 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  31.69 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  31.69 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  30.82 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 		 303 aa  136  5e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1364  Aminodeoxychorismate lyase  34.01 
 
 		 307 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  34.83 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  31.54 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  31.46 
 
 		 290 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  33.57 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  30.87 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  31.76 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  31.11 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  30.15 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  30.15 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  30.54 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  31.19 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  30.98 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  28.32 
 
 		 294 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  28.32 
 
 		 294 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  28.32 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  30.61 
 
 		 303 aa  124  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  28.32 
 
 		 290 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  31.83 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  31.23 
 
 		 307 aa  122  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3767  D-amino acid aminotransferase  28.95 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140318  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  31.23 
 
 		 307 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  31.23 
 
 		 307 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  31.23 
 
 		 307 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  31.23 
 
 		 307 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  31.23 
 
 		 307 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  31.23 
 
 		 307 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  31.23 
 
 		 307 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5082  D-amino acid aminotransferase  27.96 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5405  D-amino acid aminotransferase  27.96 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000087817  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5472  D-amino acid aminotransferase  27.96 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00355566  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  32.41 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  30.92 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  31.8 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  30.54 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  31.85 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  32.18 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  32.18 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>