More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2223 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 303 aa  628  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2140  branched-chain amino acid aminotransferase  69.44 
 
 		 322 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2271  branched-chain amino acid aminotransferase  66.22 
 
 		 299 aa  424  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  67.71 
 
 		 296 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3545  branched-chain amino acid aminotransferase  63.18 
 
 		 295 aa  400  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7270  branched-chain amino acid aminotransferase  63.54 
 
 		 295 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2556  branched-chain amino acid aminotransferase  63.16 
 
 		 297 aa  394  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0850  branched-chain amino acid aminotransferase  62 
 
 		 299 aa  396  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2587  branched-chain amino acid aminotransferase  63.19 
 
 		 295 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2615  branched-chain amino acid aminotransferase  63.19 
 
 		 295 aa  394  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.663717  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2810  branched-chain amino acid aminotransferase  63.19 
 
 		 295 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6017  branched-chain amino acid aminotransferase  62.85 
 
 		 295 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2509  branched-chain amino acid aminotransferase  61.11 
 
 		 295 aa  385  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4079  branched-chain amino acid aminotransferase  61.21 
 
 		 294 aa  360  1e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1140  branched-chain amino acid aminotransferase  57.14 
 
 		 288 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.817897  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2801  branched-chain amino acid aminotransferase  57.14 
 
 		 288 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2602  branched-chain amino acid aminotransferase  58.1 
 
 		 289 aa  345  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2786  branched-chain amino acid aminotransferase  56.45 
 
 		 288 aa  345  5e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0094  branched-chain amino acid aminotransferase  54.93 
 
 		 288 aa  345  8e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2926  branched-chain amino acid aminotransferase  55.63 
 
 		 288 aa  343  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.458427  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3301  branched-chain amino acid aminotransferase  56.34 
 
 		 289 aa  337  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6151  branched-chain amino acid aminotransferase  52.49 
 
 		 318 aa  321  9.000000000000001e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1464  aminotransferase, class IV  50 
 
 		 305 aa  268  5.9999999999999995e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  45.42 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  44.37 
 
 		 311 aa  252  6e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  44.59 
 
 		 306 aa  249  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  45.8 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  42.52 
 
 		 306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  44.85 
 
 		 307 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  44.48 
 
 		 307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  44.48 
 
 		 307 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  44.48 
 
 		 307 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  44.48 
 
 		 307 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  44.48 
 
 		 307 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  44.48 
 
 		 307 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  44.48 
 
 		 307 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  44.48 
 
 		 307 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  44.49 
 
 		 307 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  44.49 
 
 		 307 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  44.79 
 
 		 306 aa  242  7e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  44.72 
 
 		 306 aa  241  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  44.26 
 
 		 307 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  44.26 
 
 		 307 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  44.13 
 
 		 307 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  43.31 
 
 		 306 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  44.49 
 
 		 307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  44.49 
 
 		 307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  44.49 
 
 		 307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  43.75 
 
 		 307 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  42.62 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  43.66 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  42.76 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  43.45 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  42.61 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  41.18 
 
 		 316 aa  233  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  42.25 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  44.87 
 
 		 307 aa  232  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  41.49 
 
 		 311 aa  231  9e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  42.57 
 
 		 306 aa  231  9e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  42.42 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  38.85 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  42.59 
 
 		 307 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  42.59 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  42.05 
 
 		 312 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  44.53 
 
 		 313 aa  229  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  41.79 
 
 		 308 aa  228  8e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  42.21 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  38.18 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  43.89 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  42.42 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  43.91 
 
 		 305 aa  226  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  41.44 
 
 		 309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  42.16 
 
 		 307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  42.5 
 
 		 305 aa  225  6e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  42.05 
 
 		 312 aa  225  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  40.96 
 
 		 306 aa  225  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  42.96 
 
 		 306 aa  224  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  41.67 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0286  branched-chain amino acid aminotransferase  42.38 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0618931  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  41.48 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  42.7 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  42.25 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  40.15 
 
 		 317 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  42.71 
 
 		 304 aa  223  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  45.32 
 
 		 312 aa  223  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  44.03 
 
 		 312 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  42.69 
 
 		 309 aa  222  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  39.08 
 
 		 309 aa  222  7e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  43.36 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  41.9 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  43.51 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  43.34 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  43.13 
 
 		 302 aa  220  3e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4443  branched-chain amino acid aminotransferase  41.5 
 
 		 307 aa  219  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0607  branched-chain amino acid aminotransferase  42.37 
 
 		 303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000582891  decreased coverage  0.00306589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  42.31 
 
 		 308 aa  219  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  41.2 
 
 		 313 aa  219  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  43.24 
 
 		 307 aa  218  7e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0444  branched-chain amino acid aminotransferase  41.67 
 
 		 307 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.976398 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0347  branched-chain amino acid aminotransferase  39.93 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>