More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2926 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2926  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 288 aa  599  1e-170  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.458427  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0094  branched-chain amino acid aminotransferase  80.21 
 
 		 288 aa  496  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3301  branched-chain amino acid aminotransferase  79.51 
 
 		 289 aa  486  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2801  branched-chain amino acid aminotransferase  77.78 
 
 		 288 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1140  branched-chain amino acid aminotransferase  77.78 
 
 		 288 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.817897  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2786  branched-chain amino acid aminotransferase  78.12 
 
 		 288 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2602  branched-chain amino acid aminotransferase  75.09 
 
 		 289 aa  454  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2140  branched-chain amino acid aminotransferase  60 
 
 		 322 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2810  branched-chain amino acid aminotransferase  60 
 
 		 295 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2615  branched-chain amino acid aminotransferase  60.35 
 
 		 295 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.663717  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2587  branched-chain amino acid aminotransferase  60 
 
 		 295 aa  364  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2271  branched-chain amino acid aminotransferase  60.92 
 
 		 299 aa  363  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  59.3 
 
 		 296 aa  362  4e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3545  branched-chain amino acid aminotransferase  55.79 
 
 		 295 aa  351  7e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6017  branched-chain amino acid aminotransferase  57.89 
 
 		 295 aa  350  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2556  branched-chain amino acid aminotransferase  57.19 
 
 		 297 aa  349  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7270  branched-chain amino acid aminotransferase  57.54 
 
 		 295 aa  343  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  55.63 
 
 		 303 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4079  branched-chain amino acid aminotransferase  58.8 
 
 		 294 aa  340  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2509  branched-chain amino acid aminotransferase  54.39 
 
 		 295 aa  334  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0850  branched-chain amino acid aminotransferase  54.42 
 
 		 299 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6151  branched-chain amino acid aminotransferase  47.57 
 
 		 318 aa  275  9e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  42.38 
 
 		 308 aa  231  8.000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  42.26 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  42.26 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  42.26 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  41.89 
 
 		 307 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  41.29 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  41.13 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  40.21 
 
 		 306 aa  223  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  41.13 
 
 		 307 aa  222  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  41.13 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  40.75 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  40.75 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  40.75 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  42.53 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  40.75 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  40.75 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  40.75 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  40.75 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  40.75 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  41.26 
 
 		 309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  40.14 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  40.69 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  41.13 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  40.14 
 
 		 307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  41.61 
 
 		 307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  40.48 
 
 		 307 aa  219  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  38.75 
 
 		 310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  39.03 
 
 		 309 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  38.97 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  37.93 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  42.42 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  38.98 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  37.59 
 
 		 312 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  41.67 
 
 		 311 aa  211  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  38.32 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  37.54 
 
 		 307 aa  209  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  39.86 
 
 		 305 aa  209  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1464  aminotransferase, class IV  38.73 
 
 		 305 aa  209  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  39.62 
 
 		 312 aa  210  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  41.29 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  38.19 
 
 		 313 aa  208  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1404  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 		 304 aa  208  9e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  39.13 
 
 		 317 aa  208  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  39.62 
 
 		 306 aa  207  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  38.64 
 
 		 307 aa  208  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  39.77 
 
 		 307 aa  207  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  41.91 
 
 		 312 aa  207  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  38.27 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  38.85 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  41.13 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  39.59 
 
 		 306 aa  206  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  38.18 
 
 		 309 aa  205  7e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  39.51 
 
 		 306 aa  205  8e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  39.16 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  39.02 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  39.02 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  40.15 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  39.77 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  38.78 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  38.46 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0296  branched-chain amino acid aminotransferase  41.15 
 
 		 304 aa  202  5e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 		 307 aa  202  6e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  38.64 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  38.26 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2109  branched-chain amino acid aminotransferase  40.23 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0318  branched-chain amino acid aminotransferase  40.38 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  40.07 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  41.86 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  38.11 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  37.24 
 
 		 302 aa  198  7.999999999999999e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  38.24 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  38.64 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  40.07 
 
 		 304 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1707  branched-chain amino acid aminotransferase  39.62 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  40.07 
 
 		 304 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  36.92 
 
 		 296 aa  196  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>