More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2271 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2271  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 299 aa  622  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  70.75 
 
 		 296 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2140  branched-chain amino acid aminotransferase  69.18 
 
 		 322 aa  439  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2810  branched-chain amino acid aminotransferase  68.71 
 
 		 295 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2615  branched-chain amino acid aminotransferase  69.05 
 
 		 295 aa  436  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.663717  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7270  branched-chain amino acid aminotransferase  69.36 
 
 		 295 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2587  branched-chain amino acid aminotransferase  68.37 
 
 		 295 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6017  branched-chain amino acid aminotransferase  68.01 
 
 		 295 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2556  branched-chain amino acid aminotransferase  67.35 
 
 		 297 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  67.61 
 
 		 303 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3545  branched-chain amino acid aminotransferase  65.65 
 
 		 295 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2509  branched-chain amino acid aminotransferase  64.63 
 
 		 295 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0850  branched-chain amino acid aminotransferase  61.33 
 
 		 299 aa  384  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2926  branched-chain amino acid aminotransferase  60.92 
 
 		 288 aa  363  3e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.458427  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4079  branched-chain amino acid aminotransferase  58.9 
 
 		 294 aa  356  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0094  branched-chain amino acid aminotransferase  59.51 
 
 		 288 aa  350  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2801  branched-chain amino acid aminotransferase  58.93 
 
 		 288 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1140  branched-chain amino acid aminotransferase  58.93 
 
 		 288 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.817897  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2602  branched-chain amino acid aminotransferase  60 
 
 		 289 aa  342  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2786  branched-chain amino acid aminotransferase  58.21 
 
 		 288 aa  341  8e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3301  branched-chain amino acid aminotransferase  57.5 
 
 		 289 aa  337  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6151  branched-chain amino acid aminotransferase  51.35 
 
 		 318 aa  310  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  45.05 
 
 		 307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  44.33 
 
 		 306 aa  252  5.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  44.59 
 
 		 307 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  44.59 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  43.58 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  43.58 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  46.18 
 
 		 311 aa  250  3e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  44.59 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  44.59 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  44.59 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  44.59 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  44.59 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  44.59 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  44.59 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  43.58 
 
 		 307 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  45.17 
 
 		 306 aa  248  8e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  43.92 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  42.57 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  42.57 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  43.24 
 
 		 307 aa  245  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  46.56 
 
 		 308 aa  245  6e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  46.56 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  43.1 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  43.49 
 
 		 307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  44.59 
 
 		 309 aa  242  5e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  43.49 
 
 		 307 aa  242  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  43.45 
 
 		 306 aa  241  9e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  45.42 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  43.24 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  42.37 
 
 		 307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  42.37 
 
 		 307 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1464  aminotransferase, class IV  44.49 
 
 		 305 aa  239  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  42.76 
 
 		 309 aa  239  5e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  42.57 
 
 		 307 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  41.1 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  40.41 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  43.24 
 
 		 312 aa  236  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  41.22 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  42.33 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  43.25 
 
 		 306 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  42.52 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  42.52 
 
 		 313 aa  235  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  41.75 
 
 		 312 aa  235  8e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  41.22 
 
 		 312 aa  235  8e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  42.23 
 
 		 312 aa  235  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  41.89 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  45.04 
 
 		 307 aa  232  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  41.48 
 
 		 317 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  42.03 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  43.07 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  42.59 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  41.72 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  42.59 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  41.36 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  43.91 
 
 		 305 aa  228  7e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  41.91 
 
 		 308 aa  227  1e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  41.03 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  41.67 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  41.58 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  42.8 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  40.41 
 
 		 307 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  41.06 
 
 		 309 aa  223  4e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  42.61 
 
 		 307 aa  222  6e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  41.06 
 
 		 309 aa  221  8e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  40.6 
 
 		 319 aa  221  9e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  40.53 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  41.44 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  44.4 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  41.87 
 
 		 317 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  40.21 
 
 		 311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  42.47 
 
 		 307 aa  219  6e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  42.08 
 
 		 307 aa  218  7.999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  42.08 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  41.6 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  40.46 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0716  branched-chain amino acid aminotransferase  40.35 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.470563  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  40.27 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  40.14 
 
 		 303 aa  216  5e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>