More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6151 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6151  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 318 aa  657    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  53.66 
 
 		 303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  53.9 
 
 		 296 aa  318  7e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0850  branched-chain amino acid aminotransferase  52.56 
 
 		 299 aa  311  6.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2140  branched-chain amino acid aminotransferase  51.4 
 
 		 322 aa  311  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2271  branched-chain amino acid aminotransferase  51.35 
 
 		 299 aa  310  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2556  branched-chain amino acid aminotransferase  52.48 
 
 		 297 aa  308  5.9999999999999995e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2810  branched-chain amino acid aminotransferase  50.18 
 
 		 295 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2587  branched-chain amino acid aminotransferase  50.18 
 
 		 295 aa  300  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2615  branched-chain amino acid aminotransferase  50.18 
 
 		 295 aa  299  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.663717  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2509  branched-chain amino acid aminotransferase  50.88 
 
 		 295 aa  293  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7270  branched-chain amino acid aminotransferase  49.47 
 
 		 295 aa  292  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6017  branched-chain amino acid aminotransferase  49.12 
 
 		 295 aa  292  6e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299425 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3545  branched-chain amino acid aminotransferase  47.72 
 
 		 295 aa  289  5.0000000000000004e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4079  branched-chain amino acid aminotransferase  48.29 
 
 		 294 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2926  branched-chain amino acid aminotransferase  47.57 
 
 		 288 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.458427  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0094  branched-chain amino acid aminotransferase  46.15 
 
 		 288 aa  268  8.999999999999999e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2602  branched-chain amino acid aminotransferase  46.53 
 
 		 289 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2786  branched-chain amino acid aminotransferase  46.53 
 
 		 288 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1140  branched-chain amino acid aminotransferase  46.15 
 
 		 288 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.817897  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2801  branched-chain amino acid aminotransferase  46.15 
 
 		 288 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3301  branched-chain amino acid aminotransferase  45.67 
 
 		 289 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1464  aminotransferase, class IV  45.31 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  41.89 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  41.89 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  40.88 
 
 		 307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  42.96 
 
 		 307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  41.55 
 
 		 307 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  40.89 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  42.07 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  41.22 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  42.07 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  40.89 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  40.88 
 
 		 307 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  40.88 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  40.88 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  40.88 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  40.88 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  40.88 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  40.88 
 
 		 307 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  40.88 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  40.88 
 
 		 307 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  40.88 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  40.88 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  40.55 
 
 		 306 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  41.72 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  39.66 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  40.69 
 
 		 306 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  39.86 
 
 		 310 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  41.61 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  41.1 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  39.32 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  40.69 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  42.03 
 
 		 306 aa  209  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  40.34 
 
 		 307 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  41.24 
 
 		 307 aa  208  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  39.66 
 
 		 307 aa  208  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  42.27 
 
 		 311 aa  208  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  39.73 
 
 		 306 aa  206  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  36.3 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  39.93 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  38.49 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  39.1 
 
 		 307 aa  202  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  39.1 
 
 		 307 aa  202  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  38.49 
 
 		 307 aa  202  8e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  35.45 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  36.33 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  35.12 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 		 307 aa  199  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.11 
 
 		 305 aa  198  9e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  37.33 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  37.01 
 
 		 317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  42.05 
 
 		 305 aa  197  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  36.09 
 
 		 312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  36.82 
 
 		 307 aa  195  9e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  38.01 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0318  branched-chain amino acid aminotransferase  40.91 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  39.51 
 
 		 307 aa  195  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1404  branched-chain amino acid aminotransferase  40.69 
 
 		 304 aa  193  4e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0296  branched-chain amino acid aminotransferase  40.91 
 
 		 304 aa  193  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  36.55 
 
 		 309 aa  192  6e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  39.25 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  36.51 
 
 		 313 aa  192  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  34.78 
 
 		 312 aa  192  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1707  branched-chain amino acid aminotransferase  40.91 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  36.84 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  35.67 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  38.7 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  38.36 
 
 		 304 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  36.43 
 
 		 309 aa  188  8e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  38.78 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  38.54 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  36.77 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  37.97 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0549  branched-chain amino acid aminotransferase  37.37 
 
 		 303 aa  186  6e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000680418  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2109  branched-chain amino acid aminotransferase  39.52 
 
 		 304 aa  186  6e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  38.46 
 
 		 307 aa  185  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  36.27 
 
 		 296 aa  185  9e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  37.76 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0855  branched-chain amino acid aminotransferase  39.52 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>