More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1464 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1464  aminotransferase, class IV  100 
 
 		 305 aa  613  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  50 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0850  branched-chain amino acid aminotransferase  49.24 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2556  branched-chain amino acid aminotransferase  44.52 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2271  branched-chain amino acid aminotransferase  44.49 
 
 		 299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2509  branched-chain amino acid aminotransferase  43.06 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  43.77 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2140  branched-chain amino acid aminotransferase  42.7 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6151  branched-chain amino acid aminotransferase  45.31 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6017  branched-chain amino acid aminotransferase  42.96 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7270  branched-chain amino acid aminotransferase  46.06 
 
 		 295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2615  branched-chain amino acid aminotransferase  43.7 
 
 		 295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.663717  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3545  branched-chain amino acid aminotransferase  42.35 
 
 		 295 aa  232  6e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2810  branched-chain amino acid aminotransferase  42.91 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2587  branched-chain amino acid aminotransferase  42.91 
 
 		 295 aa  229  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4079  branched-chain amino acid aminotransferase  46.85 
 
 		 294 aa  229  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2786  branched-chain amino acid aminotransferase  43.31 
 
 		 288 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1140  branched-chain amino acid aminotransferase  41.2 
 
 		 288 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.817897  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2801  branched-chain amino acid aminotransferase  41.2 
 
 		 288 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0094  branched-chain amino acid aminotransferase  39.44 
 
 		 288 aa  215  9e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2602  branched-chain amino acid aminotransferase  43.31 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3301  branched-chain amino acid aminotransferase  39.79 
 
 		 289 aa  209  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2926  branched-chain amino acid aminotransferase  38.73 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.458427  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  40.28 
 
 		 306 aa  196  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  38.21 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  38.03 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  34.74 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  37.02 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  37.23 
 
 		 307 aa  185  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  35.44 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  37.22 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  36.3 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  37.23 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  37.23 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  37.23 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  37.23 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  37.23 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  37.23 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  35.11 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  37.23 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  35.71 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  36.88 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  35.23 
 
 		 307 aa  182  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  35.46 
 
 		 307 aa  182  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  37.46 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  36.52 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  34.75 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  35.11 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  35.11 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  36.93 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  37.28 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  37.1 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  37.1 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  35.46 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  37.1 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  37.1 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  37.1 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  37.1 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  37.1 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  36.82 
 
 		 307 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  35.1 
 
 		 319 aa  179  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  32.99 
 
 		 308 aa  178  8e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  38.57 
 
 		 312 aa  178  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  35.71 
 
 		 306 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  36.07 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  35.21 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  38.23 
 
 		 308 aa  176  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  34.95 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  35.86 
 
 		 312 aa  176  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  35.86 
 
 		 312 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  37.16 
 
 		 307 aa  176  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  37.24 
 
 		 307 aa  176  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  37.16 
 
 		 307 aa  176  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  34.95 
 
 		 308 aa  175  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  37.98 
 
 		 309 aa  175  8e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  38.06 
 
 		 302 aa  175  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  36.3 
 
 		 306 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  35.59 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  34.58 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  35.59 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  36.14 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  32.86 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  35.74 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  33.68 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  34.58 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  35.11 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  34.8 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4845  branched-chain amino acid aminotransferase  36.97 
 
 		 308 aa  172  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  34.88 
 
 		 307 aa  172  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  34.51 
 
 		 305 aa  172  6.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  37.41 
 
 		 306 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  35.69 
 
 		 313 aa  172  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  34.72 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  34.72 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  34.72 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  35.79 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  33.45 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  34.05 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  33.8 
 
 		 305 aa  169  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0192  branched-chain amino acid aminotransferase  31.82 
 
 		 304 aa  169  5e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.749275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>