More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2602 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2602  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 289 aa  602  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2801  branched-chain amino acid aminotransferase  75.78 
 
 		 288 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1140  branched-chain amino acid aminotransferase  75.78 
 
 		 288 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.817897  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2786  branched-chain amino acid aminotransferase  75.09 
 
 		 288 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2926  branched-chain amino acid aminotransferase  75.09 
 
 		 288 aa  454  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.458427  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0094  branched-chain amino acid aminotransferase  74.39 
 
 		 288 aa  449  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3301  branched-chain amino acid aminotransferase  74.05 
 
 		 289 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2587  branched-chain amino acid aminotransferase  59.29 
 
 		 295 aa  361  9e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2810  branched-chain amino acid aminotransferase  58.93 
 
 		 295 aa  358  7e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2615  branched-chain amino acid aminotransferase  59.29 
 
 		 295 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.663717  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6017  branched-chain amino acid aminotransferase  58.93 
 
 		 295 aa  354  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7270  branched-chain amino acid aminotransferase  58.95 
 
 		 295 aa  353  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2140  branched-chain amino acid aminotransferase  59.65 
 
 		 322 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  58.1 
 
 		 303 aa  344  8.999999999999999e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2556  branched-chain amino acid aminotransferase  57.54 
 
 		 297 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2271  branched-chain amino acid aminotransferase  60 
 
 		 299 aa  342  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  57.54 
 
 		 296 aa  342  5e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4079  branched-chain amino acid aminotransferase  60.56 
 
 		 294 aa  337  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3545  branched-chain amino acid aminotransferase  54.51 
 
 		 295 aa  333  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0850  branched-chain amino acid aminotransferase  55.48 
 
 		 299 aa  329  4e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2509  branched-chain amino acid aminotransferase  52.63 
 
 		 295 aa  317  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6151  branched-chain amino acid aminotransferase  46.53 
 
 		 318 aa  265  8.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  43.98 
 
 		 309 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  42.26 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  42.26 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  42.64 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  42.64 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  42.48 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  43.59 
 
 		 306 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  42.64 
 
 		 307 aa  225  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  41.88 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  43.4 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  42.48 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  42.26 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1404  branched-chain amino acid aminotransferase  43.94 
 
 		 304 aa  223  3e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  41.52 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  42.26 
 
 		 307 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  42.26 
 
 		 307 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  42.12 
 
 		 307 aa  222  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  42.26 
 
 		 307 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  42.26 
 
 		 307 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  42.26 
 
 		 307 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  42.26 
 
 		 307 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  43.02 
 
 		 312 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  42.26 
 
 		 307 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  42.26 
 
 		 307 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  41.89 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  42.26 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  41.89 
 
 		 307 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  41.89 
 
 		 307 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  42.42 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  42.42 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  40.83 
 
 		 305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  40.48 
 
 		 316 aa  219  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  40.21 
 
 		 313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  40.58 
 
 		 307 aa  218  7.999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  40.23 
 
 		 307 aa  217  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  40.42 
 
 		 307 aa  217  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  44.36 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  41.11 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  41.51 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  41.49 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  41.87 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  42.42 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  42.42 
 
 		 307 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  40.44 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  41.64 
 
 		 317 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  41.98 
 
 		 311 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1707  branched-chain amino acid aminotransferase  42.91 
 
 		 304 aa  215  5e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  42.8 
 
 		 306 aa  215  8e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  39.1 
 
 		 309 aa  215  8e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  40.43 
 
 		 309 aa  215  8e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1464  aminotransferase, class IV  43.31 
 
 		 305 aa  214  9e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0318  branched-chain amino acid aminotransferase  42.15 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  40.22 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  41.92 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  38.57 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  43.56 
 
 		 307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0716  branched-chain amino acid aminotransferase  38.01 
 
 		 303 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.470563  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  42.05 
 
 		 311 aa  212  4.9999999999999996e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  40.07 
 
 		 309 aa  211  9e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  42.11 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0296  branched-chain amino acid aminotransferase  41.38 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  41.92 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  39.7 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  41.16 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0607  branched-chain amino acid aminotransferase  40.79 
 
 		 303 aa  210  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000582891  decreased coverage  0.00306589 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  40.43 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  40.38 
 
 		 308 aa  209  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  38.91 
 
 		 303 aa  209  4e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706765  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  40.62 
 
 		 306 aa  209  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  40.22 
 
 		 302 aa  209  5e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  38.36 
 
 		 303 aa  209  6e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.720294 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0549  branched-chain amino acid aminotransferase  40.48 
 
 		 303 aa  208  7e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000680418  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  39.46 
 
 		 306 aa  208  7e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  41.29 
 
 		 306 aa  208  8e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2109  branched-chain amino acid aminotransferase  40.84 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  41.89 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  42.15 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>