More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1646 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
296 aa  614  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2140  branched-chain amino acid aminotransferase  80.47 
 
 
322 aa  514  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6017  branched-chain amino acid aminotransferase  72.88 
 
 
295 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0299425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7270  branched-chain amino acid aminotransferase  72.54 
 
 
295 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2810  branched-chain amino acid aminotransferase  70.85 
 
 
295 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2587  branched-chain amino acid aminotransferase  70.51 
 
 
295 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2271  branched-chain amino acid aminotransferase  70.75 
 
 
299 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2615  branched-chain amino acid aminotransferase  70.85 
 
 
295 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.663717  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2509  branched-chain amino acid aminotransferase  69.15 
 
 
295 aa  443  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3545  branched-chain amino acid aminotransferase  66.78 
 
 
295 aa  431  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2556  branched-chain amino acid aminotransferase  66.21 
 
 
297 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  67.71 
 
 
303 aa  419  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0850  branched-chain amino acid aminotransferase  65.74 
 
 
299 aa  394  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4079  branched-chain amino acid aminotransferase  61.17 
 
 
294 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2926  branched-chain amino acid aminotransferase  59.3 
 
 
288 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.458427  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0094  branched-chain amino acid aminotransferase  57.54 
 
 
288 aa  350  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3301  branched-chain amino acid aminotransferase  57.89 
 
 
289 aa  347  1e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2602  branched-chain amino acid aminotransferase  57.54 
 
 
289 aa  342  5e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2786  branched-chain amino acid aminotransferase  55.79 
 
 
288 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1140  branched-chain amino acid aminotransferase  55.09 
 
 
288 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.817897  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2801  branched-chain amino acid aminotransferase  55.09 
 
 
288 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6151  branched-chain amino acid aminotransferase  53.9 
 
 
318 aa  318  6e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  46.95 
 
 
311 aa  258  6e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  48.29 
 
 
307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  48.29 
 
 
307 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  48.29 
 
 
307 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  48.29 
 
 
307 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  48.29 
 
 
307 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  48.29 
 
 
307 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  48.29 
 
 
307 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  48.29 
 
 
307 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  48.29 
 
 
307 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  47.91 
 
 
307 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  44.75 
 
 
307 aa  249  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  47.35 
 
 
307 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  47.35 
 
 
307 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  47.35 
 
 
307 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  43.29 
 
 
306 aa  249  6e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  47.53 
 
 
307 aa  248  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  47.53 
 
 
307 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  46.39 
 
 
307 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  47.53 
 
 
307 aa  246  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  46.95 
 
 
306 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  46.39 
 
 
307 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  45.42 
 
 
309 aa  246  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  45.26 
 
 
306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  42.76 
 
 
310 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  45.04 
 
 
307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  44.27 
 
 
308 aa  241  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  43.39 
 
 
306 aa  241  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  44.49 
 
 
312 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  43.73 
 
 
307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  43.73 
 
 
307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  44.11 
 
 
312 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  44.11 
 
 
312 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  44.03 
 
 
307 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  43.07 
 
 
307 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1464  aminotransferase, class IV  43.77 
 
 
305 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  44.27 
 
 
309 aa  236  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  44.49 
 
 
312 aa  236  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  43.7 
 
 
305 aa  237  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  44.7 
 
 
313 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  42.37 
 
 
307 aa  235  7e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  42.7 
 
 
317 aa  235  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  42.37 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  40.54 
 
 
309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  43.98 
 
 
316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  44.11 
 
 
312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  44.57 
 
 
306 aa  232  5e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  43.13 
 
 
307 aa  231  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  42.75 
 
 
306 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  43.54 
 
 
313 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  42.32 
 
 
306 aa  229  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  41.22 
 
 
304 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  40.82 
 
 
307 aa  227  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  42.41 
 
 
296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  44.79 
 
 
307 aa  225  5.0000000000000005e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  42.64 
 
 
309 aa  225  6e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  43.13 
 
 
302 aa  225  9e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  41.2 
 
 
307 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  41.06 
 
 
309 aa  223  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  40.84 
 
 
306 aa  223  4e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  40.68 
 
 
309 aa  222  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  41.67 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  43.68 
 
 
306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  41.79 
 
 
307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  39.73 
 
 
307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  41.98 
 
 
305 aa  219  5e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1404  branched-chain amino acid aminotransferase  42.86 
 
 
304 aa  218  8.999999999999998e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  42.54 
 
 
309 aa  217  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  40.07 
 
 
307 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  42.37 
 
 
306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  41.38 
 
 
319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 
303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  43.35 
 
 
304 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  40.35 
 
 
303 aa  212  7e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.720294 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0716  branched-chain amino acid aminotransferase  39.3 
 
 
303 aa  211  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.470563  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  43.87 
 
 
304 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  43.12 
 
 
304 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  43.28 
 
 
309 aa  211  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>