More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1586 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1911  4-amino-4-deoxychorismate lyase, putative  100 
 
 
277 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.129492  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1586  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
277 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0753996 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  38.3 
 
 
288 aa  152  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1528  4-amino-4-deoxychorismate lyase  40.66 
 
 
271 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1502  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  39.16 
 
 
271 aa  149  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0156373  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  38.26 
 
 
273 aa  149  7e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4154  4-amino-4-deoxychorismate lyase  41.09 
 
 
271 aa  148  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0929284  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1418  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  40.29 
 
 
285 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.711679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3829  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.63 
 
 
271 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.74 
 
 
270 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1650  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.15 
 
 
271 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159709  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  41.2 
 
 
271 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14950  4-amino-4-deoxychorismate lyase  41.9 
 
 
271 aa  142  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25710  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.91 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0077515  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1493  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.19 
 
 
271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1998  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.13 
 
 
276 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1917  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.73 
 
 
271 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307364  unclonable  0.000000254306 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1092  aminotransferase, class IV  32.68 
 
 
278 aa  130  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02905  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.05 
 
 
271 aa  128  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3797  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.36 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172255  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0716  aminotransferase, class IV  32.62 
 
 
295 aa  124  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0327665  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.68 
 
 
267 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1626  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.69 
 
 
267 aa  118  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2119  aminotransferase, class IV  33.05 
 
 
271 aa  118  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00194364  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2500  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.4 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00140105  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3495  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.34 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429214  hitchhiker  0.00824664 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  32.05 
 
 
271 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1689  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.34 
 
 
268 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00992906  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1581  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.63 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2269  aminotransferase class IV  33.61 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.4966  normal  0.194503 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002999  aminodeoxychorismate lyase  31.36 
 
 
271 aa  113  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0085011  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2243  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.56 
 
 
268 aa  113  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000604374  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1604  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  36.6 
 
 
271 aa  113  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0300662  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2804  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.19 
 
 
265 aa  112  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00411818  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  32.19 
 
 
271 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1909  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.62 
 
 
265 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  decreased coverage  0.000000690882 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1274  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.51 
 
 
269 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131481  normal  0.593552 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1475  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.48 
 
 
269 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000862113  hitchhiker  0.00000000000021335 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2228  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.07 
 
 
269 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000140571  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1545  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  34.58 
 
 
268 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.185803  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1217  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.07 
 
 
269 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222751  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.74 
 
 
290 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2551  aminodeoxychorismate lyase  32.2 
 
 
269 aa  106  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103186  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2031  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.07 
 
 
269 aa  105  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000010849  hitchhiker  0.00000935135 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01092  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.65 
 
 
269 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2505  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.65 
 
 
269 aa  105  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018668  unclonable  0.0000000105414 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01100  hypothetical protein  31.65 
 
 
269 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000707213  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1218  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.65 
 
 
269 aa  105  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350688  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.6 
 
 
277 aa  105  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  32.81 
 
 
277 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2300  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.86 
 
 
268 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187606  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1297  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.12 
 
 
269 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0225014  hitchhiker  1.45704e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1988  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.12 
 
 
269 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000218178  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1312  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.12 
 
 
269 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.0000000000000833328 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2171  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.12 
 
 
269 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  decreased coverage  0.000000000000025967 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1920  aminodeoxychorismate lyase  34.57 
 
 
305 aa  100  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.130955  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1364  Aminodeoxychorismate lyase  29.5 
 
 
307 aa  99  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  29.41 
 
 
276 aa  97.1  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  31.6 
 
 
282 aa  95.9  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  30.51 
 
 
288 aa  95.5  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2053  aminotransferase, class IV  30.38 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1764  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  31.85 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2045  aminodeoxychorismate lyase  31.2 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1255  aminodeoxychorismate lyase  30.74 
 
 
269 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489867  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1864  aminodeoxychorismate lyase  33.98 
 
 
272 aa  94  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.358986  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  32.38 
 
 
269 aa  94  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2615  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.85 
 
 
269 aa  93.2  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  31.97 
 
 
269 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  30.53 
 
 
292 aa  92.4  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  30.86 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  29.91 
 
 
281 aa  89.7  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0068  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31 
 
 
291 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  29.91 
 
 
287 aa  89.4  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  31.91 
 
 
266 aa  89.4  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  29.59 
 
 
278 aa  89.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1611  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.17 
 
 
271 aa  89  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02332  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.36 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  27.84 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2242  aminotransferase, class IV  29.96 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  31.91 
 
 
298 aa  87  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0610  aminotransferase class IV  25.94 
 
 
246 aa  87  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0570431  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  27.82 
 
 
274 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  28.46 
 
 
285 aa  87  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0432  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.76 
 
 
267 aa  85.9  6e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1921  aminodeoxychorismate lyase  27.1 
 
 
300 aa  85.5  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0121  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase-like protein  32.04 
 
 
326 aa  85.5  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0823171  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  30.31 
 
 
274 aa  85.5  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  28.2 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.48 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2216  aminotransferase, class IV  29.39 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  26.49 
 
 
293 aa  84  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1273  putative branched-chain amino acid aminotransferase  25.83 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  28.57 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09633  branched-chain amino acid aminotransferase  25.78 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.396462  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  27.86 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0976  branched-chain amino acid aminotransferase family protein  28.68 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167546  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  27.37 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  28.3 
 
 
289 aa  82  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  26.39 
 
 
288 aa  82  0.000000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>