More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0976 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0976  branched-chain amino acid aminotransferase family protein  100 
 
 
278 aa  568  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167546  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  32.7 
 
 
295 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  31.2 
 
 
288 aa  136  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  31.75 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  31.75 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  31.75 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  31.39 
 
 
298 aa  133  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  31.75 
 
 
298 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  31.75 
 
 
298 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  31.75 
 
 
298 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  31.75 
 
 
298 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  31.39 
 
 
298 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  29.86 
 
 
297 aa  132  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  32.2 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  29.66 
 
 
293 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  31.02 
 
 
298 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.25 
 
 
277 aa  128  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  29.62 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  32.83 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  29.89 
 
 
299 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2839  aminotransferase class IV  34.41 
 
 
307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0464301  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2744  aminotransferase class IV  34.41 
 
 
307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  30.53 
 
 
299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  30.04 
 
 
291 aa  125  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  29.6 
 
 
292 aa  125  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  32.83 
 
 
347 aa  122  7e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  32.58 
 
 
290 aa  122  9e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  30.68 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  29.7 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  30.3 
 
 
292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2654  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  31.67 
 
 
307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  28.57 
 
 
297 aa  119  7e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  28.57 
 
 
293 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  28.41 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  29.37 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  30.71 
 
 
288 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  32.08 
 
 
292 aa  115  7.999999999999999e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  28.26 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  30.22 
 
 
287 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  31.65 
 
 
276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.47 
 
 
290 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5238  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.47 
 
 
290 aa  112  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127403 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  28.68 
 
 
287 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  29.77 
 
 
288 aa  112  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  30.83 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.28 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  28.68 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.28 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  27.47 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  31.3 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  29.06 
 
 
287 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.27 
 
 
290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.27 
 
 
290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  29.06 
 
 
295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  28.37 
 
 
286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.27 
 
 
290 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0079  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.27 
 
 
290 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128474 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  32.74 
 
 
310 aa  109  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  27.86 
 
 
299 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  27.48 
 
 
299 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  27.48 
 
 
299 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  27.48 
 
 
299 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  27.48 
 
 
299 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.84 
 
 
290 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  27.48 
 
 
299 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  27.48 
 
 
299 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  27.48 
 
 
299 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  27.48 
 
 
299 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.84 
 
 
285 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  27.48 
 
 
299 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  30.07 
 
 
298 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  29.43 
 
 
276 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  32.18 
 
 
288 aa  106  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  31.42 
 
 
311 aa  106  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  27.5 
 
 
286 aa  106  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14950  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.85 
 
 
271 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.74 
 
 
290 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  29.55 
 
 
300 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  31.43 
 
 
285 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  28.95 
 
 
290 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  28.95 
 
 
294 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  28.95 
 
 
294 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  28.25 
 
 
311 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  26.67 
 
 
292 aa  103  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5082  D-amino acid aminotransferase  28.95 
 
 
294 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5472  D-amino acid aminotransferase  28.95 
 
 
290 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00355566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  28.68 
 
 
306 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  31.66 
 
 
266 aa  102  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.78 
 
 
271 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1650  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.14 
 
 
271 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159709  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37740  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.44 
 
 
282 aa  102  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341981 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1418  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  31.85 
 
 
285 aa  102  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.711679 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  30.04 
 
 
274 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  30.77 
 
 
282 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  29.17 
 
 
281 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5405  D-amino acid aminotransferase  28.2 
 
 
290 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000087817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  28.57 
 
 
290 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1364  Aminodeoxychorismate lyase  29.82 
 
 
307 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>