More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3272 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  100 
 
 
280 aa  550  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  73.57 
 
 
280 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  61.84 
 
 
274 aa  324  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  58.3 
 
 
276 aa  311  7.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  55.16 
 
 
276 aa  298  8e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  56.07 
 
 
278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  54.58 
 
 
274 aa  258  9e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  52.88 
 
 
281 aa  226  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  45.95 
 
 
292 aa  215  7e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  49.15 
 
 
283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  50.54 
 
 
287 aa  199  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15470  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  42.63 
 
 
313 aa  196  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0160772  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  36.03 
 
 
288 aa  142  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  34.05 
 
 
299 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  34.91 
 
 
299 aa  142  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  34.05 
 
 
299 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  34.05 
 
 
299 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  34.05 
 
 
299 aa  142  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  34.05 
 
 
299 aa  142  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  34.05 
 
 
299 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  34.05 
 
 
299 aa  142  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  34.05 
 
 
299 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  33.69 
 
 
299 aa  142  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  34.05 
 
 
299 aa  141  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  34.72 
 
 
298 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  34.84 
 
 
297 aa  137  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  34.38 
 
 
298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  34.72 
 
 
298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  34.72 
 
 
298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  34.72 
 
 
298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  34.72 
 
 
298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  34.38 
 
 
298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  34.38 
 
 
298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  34.38 
 
 
298 aa  136  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  34.18 
 
 
288 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  32.36 
 
 
299 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  33.45 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  34.15 
 
 
292 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  32.85 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  32.39 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  38.29 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  35.23 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  32.48 
 
 
287 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  33.94 
 
 
292 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  35.14 
 
 
289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  33.45 
 
 
287 aa  132  6e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  32.74 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  32.99 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  32.75 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  32 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  34.29 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  31.21 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  31.48 
 
 
293 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  31.88 
 
 
282 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  34.15 
 
 
297 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  32.29 
 
 
299 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  33.7 
 
 
347 aa  124  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  32.06 
 
 
299 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  34.05 
 
 
295 aa  122  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  30.99 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  31.32 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  32.75 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  33.69 
 
 
282 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0188  aminotransferase class IV  37.36 
 
 
276 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  35.46 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2839  aminotransferase class IV  36.33 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0464301  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  35.84 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  36.96 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  31.9 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2744  aminotransferase class IV  37.02 
 
 
307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2654  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  37.37 
 
 
307 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1383  aminotransferase class IV  37.85 
 
 
276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.0488839 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  32.64 
 
 
303 aa  115  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  29.97 
 
 
295 aa  115  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.36 
 
 
290 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  36.17 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  31.16 
 
 
290 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  31.32 
 
 
288 aa  112  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  32.25 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2928  aminotransferase class IV  35.52 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213699  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  32.46 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  34.36 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  36.13 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  31.65 
 
 
295 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  29.33 
 
 
307 aa  109  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.07 
 
 
285 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1364  Aminodeoxychorismate lyase  34.48 
 
 
307 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  30.6 
 
 
298 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  33.57 
 
 
282 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  40.08 
 
 
296 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  31.65 
 
 
307 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  33.46 
 
 
308 aa  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.53 
 
 
308 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  32.59 
 
 
266 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  33.8 
 
 
285 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  31.88 
 
 
311 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  35.31 
 
 
292 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  32.92 
 
 
288 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  31.58 
 
 
294 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>