More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_15470 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_15470  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  100 
 
 
313 aa  622  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0160772  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  50.36 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  48.3 
 
 
274 aa  203  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  43.89 
 
 
280 aa  202  8e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  43.37 
 
 
278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  42.02 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  42.63 
 
 
280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  40.2 
 
 
276 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  40.58 
 
 
276 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  45.63 
 
 
281 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  46.91 
 
 
287 aa  176  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  42.65 
 
 
292 aa  175  9e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  35.38 
 
 
290 aa  130  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  34.24 
 
 
297 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  34.63 
 
 
277 aa  125  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  31.37 
 
 
295 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  34.63 
 
 
289 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  33.07 
 
 
288 aa  124  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  32.95 
 
 
293 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  32.25 
 
 
297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  31.56 
 
 
299 aa  119  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  32.95 
 
 
292 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  27.69 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.52 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.64 
 
 
290 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.68 
 
 
290 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  28.99 
 
 
287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  30.77 
 
 
293 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  29.08 
 
 
286 aa  116  5e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  30.38 
 
 
293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.78 
 
 
290 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0079  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.78 
 
 
290 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128474 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  34.38 
 
 
285 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.4 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.4 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  29.55 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  34.51 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.03 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.46 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  30.5 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  34.16 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0068  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.46 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  31.94 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  30.65 
 
 
286 aa  113  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.64 
 
 
290 aa  113  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  30.5 
 
 
288 aa  112  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  31.6 
 
 
288 aa  112  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  32.81 
 
 
299 aa  112  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  32.81 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  32.81 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  32.81 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  32.81 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  32.81 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  35.34 
 
 
285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  32.81 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  28.38 
 
 
287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  32.18 
 
 
292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  32.81 
 
 
299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5238  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.25 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127403 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  31.27 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  32.03 
 
 
292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  30.08 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  32.03 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  33.72 
 
 
280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  26.86 
 
 
293 aa  109  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.43 
 
 
285 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  29.57 
 
 
282 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  26.38 
 
 
291 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  32.13 
 
 
299 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  31.13 
 
 
347 aa  106  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  30.12 
 
 
299 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  30.43 
 
 
282 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  35.25 
 
 
285 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  29.35 
 
 
311 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  34.88 
 
 
285 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  31.62 
 
 
295 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  33.72 
 
 
292 aa  103  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  30.47 
 
 
299 aa  102  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0051  aminotransferase class IV  37.65 
 
 
279 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  30.43 
 
 
307 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4024  aminotransferase, class IV  29.92 
 
 
285 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  31.46 
 
 
283 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  30.83 
 
 
294 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  32.05 
 
 
286 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  30.74 
 
 
300 aa  100  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4955  aminotransferase class IV  31.82 
 
 
496 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0111871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3053  aminotransferase, class IV  31.82 
 
 
496 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  30.52 
 
 
298 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  30.52 
 
 
298 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5314  aminotransferase, class IV  31.82 
 
 
317 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  35.27 
 
 
287 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  30.52 
 
 
298 aa  99  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  30.52 
 
 
298 aa  99  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  31.33 
 
 
298 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  31.33 
 
 
298 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  31.33 
 
 
298 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  31.33 
 
 
298 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  30.59 
 
 
284 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  30.92 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  30.22 
 
 
303 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>