More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2240 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2240  aminotransferase class IV  100 
 
 		 270 aa  546  1e-154  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2604  aminotransferase class IV  78.15 
 
 		 270 aa  421  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.946338  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29691  aminotransferases class-IV  56.04 
 
 		 286 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21671  aminotransferases class-IV  49.62 
 
 		 275 aa  285  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.221172 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1295  aminotransferase class-IV  48.5 
 
 		 275 aa  279  4e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.326181  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18261  aminotransferase class-IV  44.69 
 
 		 276 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18841  aminotransferases class-IV  37 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1786  aminotransferase class-IV  37.36 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.285091  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19031  aminotransferases class-IV  36.63 
 
 		 275 aa  202  4e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35016  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18841  aminotransferases class-IV  34.91 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  36.36 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2898  aminotransferase, class IV  34.7 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.051905 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  35.5 
 
 		 269 aa  132  6.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  31.87 
 
 		 282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.08 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  35.34 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  34.26 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  31.98 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  29.73 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  37.1 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1139  aminotransferase class IV  35.95 
 
 		 288 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.092565  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  34.72 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  34.63 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.45 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  33.6 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  28.79 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  32 
 
 		 277 aa  99  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4377  aminotransferase class IV  33.06 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.505275  normal  0.583274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  32.16 
 
 		 280 aa  92.8  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  31.25 
 
 		 300 aa  92.8  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  31.75 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  31.42 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  31.92 
 
 		 283 aa  92  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  27.96 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  29.32 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  31.92 
 
 		 282 aa  90.1  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  33.79 
 
 		 287 aa  89.7  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  27.96 
 
 		 287 aa  89  7e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  30.94 
 
 		 274 aa  89.4  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  28.64 
 
 		 288 aa  89  8e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  28.57 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  27.96 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1650  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.17 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159709  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  28.91 
 
 		 281 aa  87.4  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3829  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.12 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  28.1 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  28.91 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  27.69 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  29.34 
 
 		 281 aa  86.7  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  29.15 
 
 		 298 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  29.15 
 
 		 298 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  28.25 
 
 		 298 aa  85.9  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  28.25 
 
 		 298 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  28.25 
 
 		 298 aa  85.9  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  28.25 
 
 		 298 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  24.83 
 
 		 293 aa  85.9  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  29.15 
 
 		 298 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  29.15 
 
 		 298 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0051  aminotransferase class IV  34.38 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  30.85 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  27.4 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  26.29 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  28.7 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  29.92 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  27.75 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  26.47 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1636  aminotransferase class IV  33.78 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14950  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.15 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3571  aminotransferase class IV  30.34 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.210184  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  25.45 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  24.16 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  25.61 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  29.36 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  27.5 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  24.65 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  26.13 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4154  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.06 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0929284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  31.8 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  24.09 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  26.25 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1604  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  31.84 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0300662  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0976  branched-chain amino acid aminotransferase family protein  30.82 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167546  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  24.77 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1095  branched-chain amino acid aminotransferase, putative  25.26 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0167966  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  24.91 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0141  aminotransferase, class IV  25.4 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  24.77 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.03 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  25.46 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  25.46 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  25 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  25 
 
 		 299 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  25 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  29.85 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  29.85 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  25 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  25 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  25 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  31.28 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>