More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0141 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0141  aminotransferase, class IV  100 
 
 
278 aa  565  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09633  branched-chain amino acid aminotransferase  53.28 
 
 
279 aa  303  2.0000000000000002e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.396462  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0580  aminotransferase class IV  49.64 
 
 
284 aa  286  2e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6961  aminotransferase class IV  33.58 
 
 
278 aa  175  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122749  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1220  aminotransferase class IV  31.66 
 
 
278 aa  159  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1202  aminotransferase class IV  32.53 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  30.25 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  29.89 
 
 
281 aa  115  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  30.9 
 
 
292 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1302  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  33.7 
 
 
272 aa  112  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0291575  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  31.76 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  30.58 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  28.99 
 
 
282 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 
288 aa  108  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  30.69 
 
 
299 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  30.36 
 
 
295 aa  106  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  30.27 
 
 
298 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  28.37 
 
 
293 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 
299 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 
299 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 
299 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 
299 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 
299 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 
299 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 
299 aa  102  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  29.6 
 
 
299 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 
299 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  29.55 
 
 
299 aa  102  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  29.5 
 
 
298 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  29.5 
 
 
298 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  29.5 
 
 
298 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  29.5 
 
 
298 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  29.5 
 
 
298 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  29.5 
 
 
298 aa  102  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  29.5 
 
 
298 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  29.5 
 
 
298 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  29.5 
 
 
298 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  27.8 
 
 
293 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  27.96 
 
 
288 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  29.23 
 
 
291 aa  99.8  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  29.89 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  28.84 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  27.14 
 
 
282 aa  96.3  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  28.36 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  25.34 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  30.52 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.96 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  26.02 
 
 
288 aa  95.1  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  28.57 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1366  branched-chain amino acid aminotransferase  30.08 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.74 
 
 
271 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  27.69 
 
 
291 aa  92.8  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  27.76 
 
 
290 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  27.76 
 
 
294 aa  92.4  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  27.76 
 
 
294 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  27.76 
 
 
290 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1998  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.31 
 
 
276 aa  92  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5405  D-amino acid aminotransferase  27.35 
 
 
290 aa  92  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000087817  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  27.41 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3767  D-amino acid aminotransferase  30.2 
 
 
290 aa  91.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140318  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  29.87 
 
 
288 aa  91.3  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1655  D-amino acid aminotransferase  27.8 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405674  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1632  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  25.99 
 
 
289 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.114958  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  28.57 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  27.73 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  24.82 
 
 
306 aa  90.5  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  28.12 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5082  D-amino acid aminotransferase  27.35 
 
 
294 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5472  D-amino acid aminotransferase  27.35 
 
 
290 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00355566  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  25.53 
 
 
306 aa  89.7  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  27.9 
 
 
296 aa  89.7  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25 
 
 
267 aa  89.4  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  27.6 
 
 
280 aa  89  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  27.76 
 
 
290 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.1 
 
 
290 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  29.01 
 
 
292 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  28.42 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  29.89 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  28.74 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  30.42 
 
 
271 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15470  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.15 
 
 
313 aa  87  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0160772  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  28.19 
 
 
299 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  28.79 
 
 
292 aa  86.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  26.89 
 
 
285 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0009  branched-chain amino acid aminotransferase  25.87 
 
 
306 aa  86.3  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  27.57 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  26.46 
 
 
291 aa  86.3  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  26.46 
 
 
291 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  26.8 
 
 
291 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.7 
 
 
290 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2300  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.38 
 
 
268 aa  85.9  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1476  D-amino acid aminotransferase  29.41 
 
 
287 aa  85.9  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  27.34 
 
 
291 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.62 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  27.21 
 
 
291 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  25.43 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  27.21 
 
 
291 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  24.91 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  25.59 
 
 
284 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  26.89 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>