More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0580 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0580  aminotransferase class IV  100 
 
 		 284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09633  branched-chain amino acid aminotransferase  54.12 
 
 		 279 aa  324  1e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.396462  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0141  aminotransferase, class IV  49.64 
 
 		 278 aa  286  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6961  aminotransferase class IV  33.83 
 
 		 278 aa  165  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1202  aminotransferase class IV  33.46 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1220  aminotransferase class IV  31.25 
 
 		 278 aa  148  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  28.57 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  31.03 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  28.57 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  28.69 
 
 		 288 aa  99  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  29.62 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1998  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.43 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  25.97 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  26.87 
 
 		 282 aa  94  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.31 
 
 		 290 aa  92.8  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  29.07 
 
 		 292 aa  91.3  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1302  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  27.38 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0291575  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0610  aminotransferase class IV  27.35 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0570431  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  26.88 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2269  aminotransferase class IV  28.57 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.4966  normal  0.194503 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  28.29 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  29.6 
 
 		 287 aa  89.7  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  30.04 
 
 		 295 aa  89.7  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2300  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.92 
 
 		 268 aa  89.4  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187606  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.65 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  26.34 
 
 		 292 aa  89.4  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1418  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  30.08 
 
 		 285 aa  89  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711679 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002999  aminodeoxychorismate lyase  28.15 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0085011  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.6 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  27.06 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  26.61 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  26.61 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  26.61 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  26.61 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  26.61 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  26.61 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  26.61 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  26.61 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  26.61 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  31.44 
 
 		 302 aa  86.7  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  29.2 
 
 		 287 aa  86.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2898  aminotransferase, class IV  25.7 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.051905 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25 
 
 		 267 aa  86.3  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  28.8 
 
 		 287 aa  85.9  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2119  aminotransferase, class IV  26.54 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00194364  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  28.35 
 
 		 277 aa  85.5  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  24.43 
 
 		 293 aa  85.5  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  26.21 
 
 		 298 aa  85.5  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02905  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.53 
 
 		 271 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  23.66 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2243  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.59 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000604374  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  25.76 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  26.22 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0716  aminotransferase, class IV  26.52 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0327665  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  27.44 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  26.95 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.24 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.47 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1475  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.39 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000862113  hitchhiker  0.00000000000021335 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  26.92 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  27.03 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  25.58 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  25.48 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2500  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.38 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00140105  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1217  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.39 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222751  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  27.37 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01092  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.39 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2031  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.14 
 
 		 269 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000010849  hitchhiker  0.00000935135 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2551  aminodeoxychorismate lyase  27.27 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103186  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  29.28 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  26.87 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1218  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.39 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.47 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  27.37 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01100  hypothetical protein  27.39 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000707213  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  25.56 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  26.04 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  26.09 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  27.64 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2505  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.39 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018668  unclonable  0.0000000105414 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  27.34 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  26.91 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2228  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.16 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000140571  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  27.78 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.98 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  26.05 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5238  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.16 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127403 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1297  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.51 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0225014  hitchhiker  1.45704e-16 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  24.42 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.44 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1545  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  25 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.185803  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  24.9 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  26.57 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  25.48 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  24.79 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  25.46 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.82 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  28.04 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.24 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>