More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1302 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1302  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  100 
 
 
272 aa  566  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0291575  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1202  aminotransferase class IV  31.34 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1220  aminotransferase class IV  32.24 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09633  branched-chain amino acid aminotransferase  29.41 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.396462  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0141  aminotransferase, class IV  33.7 
 
 
278 aa  112  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6961  aminotransferase class IV  31.75 
 
 
278 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122749  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.77 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.92 
 
 
290 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.55 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.19 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.63 
 
 
290 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  25.2 
 
 
266 aa  92.8  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0580  aminotransferase class IV  27.38 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5238  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.24 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127403 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.19 
 
 
290 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.47 
 
 
285 aa  89.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  24.81 
 
 
311 aa  89  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0068  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.79 
 
 
291 aa  89  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.92 
 
 
290 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.92 
 
 
290 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  27.13 
 
 
292 aa  88.2  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002999  aminodeoxychorismate lyase  26.02 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0085011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.92 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0079  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.92 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128474 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  23.72 
 
 
310 aa  87  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  26.42 
 
 
264 aa  86.3  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  26.14 
 
 
286 aa  86.3  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2500  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.45 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00140105  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  25 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  24.81 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2699  aminotransferase class IV  25 
 
 
305 aa  82.4  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1364  Aminodeoxychorismate lyase  24.35 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  24.05 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3708  aminotransferase, class IV  24.77 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464528  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1626  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.39 
 
 
267 aa  79  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2119  aminotransferase, class IV  24.61 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00194364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  26.62 
 
 
299 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.5 
 
 
277 aa  79  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  26.24 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  24.78 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2928  aminotransferase class IV  23.59 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213699  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2804  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.73 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00411818  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  25.86 
 
 
299 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  24.09 
 
 
288 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  25.86 
 
 
299 aa  77  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  26.67 
 
 
295 aa  77  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  22.57 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5244  aminotransferase class IV  23.77 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  26.62 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2653  aminotransferase, class IV  23.4 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0838817  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1475  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.16 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000862113  hitchhiker  0.00000000000021335 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0976  branched-chain amino acid aminotransferase family protein  24.54 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167546  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2269  aminotransferase class IV  27.03 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.4966  normal  0.194503 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  25.48 
 
 
299 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2551  aminodeoxychorismate lyase  25.1 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103186  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  25.48 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  25.48 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  25.48 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  25.48 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  24.81 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  25.48 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1476  D-amino acid aminotransferase  22.93 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0432  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.18 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  25.6 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  25.48 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.64 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  27.84 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2228  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.3 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000140571  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  25.46 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1095  branched-chain amino acid aminotransferase, putative  28.08 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0167966  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01092  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.16 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  29.73 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  29.73 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  23.19 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1218  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.16 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350688  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  29.73 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2505  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.16 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018668  unclonable  0.0000000105414 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1217  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.16 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222751  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01100  hypothetical protein  28.16 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000707213  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  29.73 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  29.73 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  26.35 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  22.05 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  28.57 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1228  branched-chain amino acid aminotransferase  25.56 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000631212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  29.73 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  24.43 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  29.73 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  23.97 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  24.49 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2031  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.3 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000010849  hitchhiker  0.00000935135 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  29.73 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  29.82 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  22.9 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  24.81 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  29.36 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  22.81 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  24.08 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  21.51 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>