More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1220 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1220  aminotransferase class IV  100 
 
 		 278 aa  578  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6961  aminotransferase class IV  38.43 
 
 		 278 aa  201  9e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0141  aminotransferase, class IV  31.66 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0580  aminotransferase class IV  31.25 
 
 		 284 aa  148  8e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09633  branched-chain amino acid aminotransferase  30.37 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.396462  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1202  aminotransferase class IV  33.2 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1302  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  32.24 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0291575  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.84 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  28.74 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1998  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.48 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.72 
 
 		 290 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  28.06 
 
 		 310 aa  99  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  27.08 
 
 		 277 aa  99  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  27.84 
 
 		 287 aa  99  8e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  27.84 
 
 		 281 aa  98.6  9e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  31.75 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.84 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  29.72 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  30.34 
 
 		 296 aa  96.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5238  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.03 
 
 		 290 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127403 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.63 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.63 
 
 		 290 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1418  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  28.33 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711679 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  29.08 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  29.08 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  29.08 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  29.08 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  29.08 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  29.08 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  29.08 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  28.57 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  28.51 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  28.98 
 
 		 291 aa  93.2  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  28.69 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  29.08 
 
 		 299 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.05 
 
 		 285 aa  92.4  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  28.46 
 
 		 288 aa  92.4  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002999  aminodeoxychorismate lyase  28.02 
 
 		 271 aa  92  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0085011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  28.4 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  28.57 
 
 		 293 aa  90.5  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  27.9 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.69 
 
 		 290 aa  89.7  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  26.8 
 
 		 298 aa  89.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.31 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  29.74 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02905  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.29 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  28.57 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  26.59 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  28.34 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  26.38 
 
 		 297 aa  87.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  26.69 
 
 		 285 aa  86.7  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  28.06 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.53 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0079  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.53 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128474 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.91 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.91 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  27.09 
 
 		 298 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  27.49 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  27.49 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  27.49 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  27.09 
 
 		 298 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  27.49 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  27.49 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1764  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  27.62 
 
 		 269 aa  85.9  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  27.86 
 
 		 287 aa  85.9  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  27.09 
 
 		 298 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3708  aminotransferase, class IV  27.34 
 
 		 288 aa  85.5  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  27.09 
 
 		 298 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  27.08 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  28.11 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  25.87 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  27.01 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.58 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  25.77 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  28.34 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.2 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  28.03 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  27.02 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  27.65 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0444  branched-chain amino acid aminotransferase  26.25 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.976398 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  28.08 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  28.85 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15470  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.91 
 
 		 313 aa  82  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0160772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  26.59 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2031  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.3 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000010849  hitchhiker  0.00000935135 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2804  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.5 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00411818  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  27.2 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  29.48 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  29.07 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01092  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.3 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  27.5 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01100  hypothetical protein  24.3 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000707213  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  25.73 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1218  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.3 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350688  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0432  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.34 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  26.78 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2505  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.3 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018668  unclonable  0.0000000105414 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  25 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2551  aminodeoxychorismate lyase  23.92 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103186  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  25 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>