More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1202 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1202  aminotransferase class IV  100 
 
 
277 aa  577  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0580  aminotransferase class IV  33.46 
 
 
284 aa  161  9e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1302  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  31.34 
 
 
272 aa  161  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0291575  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1220  aminotransferase class IV  33.86 
 
 
278 aa  155  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09633  branched-chain amino acid aminotransferase  32.68 
 
 
279 aa  149  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.396462  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0141  aminotransferase, class IV  32.53 
 
 
278 aa  149  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6961  aminotransferase class IV  32.94 
 
 
278 aa  139  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122749  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.98 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  31.89 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  29.15 
 
 
281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  29.15 
 
 
287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  32.24 
 
 
310 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  30.25 
 
 
311 aa  104  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  31.27 
 
 
282 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  29.62 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1274  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.17 
 
 
269 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131481  normal  0.593552 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.98 
 
 
290 aa  96.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.01 
 
 
290 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.94 
 
 
285 aa  95.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.77 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.12 
 
 
290 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002999  aminodeoxychorismate lyase  29.29 
 
 
271 aa  92.8  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0085011  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.73 
 
 
290 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  28.84 
 
 
269 aa  92  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  29.48 
 
 
271 aa  92  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0610  aminotransferase class IV  25.99 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0570431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0068  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.13 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  28.52 
 
 
296 aa  90.5  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01092  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.86 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1998  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.74 
 
 
276 aa  90.1  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01100  hypothetical protein  27.86 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000707213  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2505  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.86 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018668  unclonable  0.0000000105414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1218  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.86 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350688  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1297  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.2 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0225014  hitchhiker  1.45704e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5238  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.46 
 
 
290 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127403 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1475  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.24 
 
 
269 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000862113  hitchhiker  0.00000000000021335 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1217  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.86 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222751  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2500  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.49 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00140105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.12 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2171  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.8 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  decreased coverage  0.000000000000025967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1988  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.8 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000218178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.12 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2228  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.24 
 
 
269 aa  87.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000140571  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.12 
 
 
290 aa  87  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0079  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.12 
 
 
290 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128474 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1312  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.8 
 
 
269 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.0000000000000833328 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2031  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.7 
 
 
269 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000010849  hitchhiker  0.00000935135 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.21 
 
 
267 aa  86.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  28.93 
 
 
288 aa  86.3  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2551  aminodeoxychorismate lyase  27.05 
 
 
269 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.46 
 
 
290 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2119  aminotransferase, class IV  27.42 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00194364  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  27.88 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0432  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.96 
 
 
267 aa  84  0.000000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  27.88 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2269  aminotransferase class IV  27.42 
 
 
275 aa  84  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.4966  normal  0.194503 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  30.38 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02332  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.82 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  29.47 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  27.92 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1364  Aminodeoxychorismate lyase  29.18 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  25.4 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  27.42 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2300  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.48 
 
 
268 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1909  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.98 
 
 
265 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  decreased coverage  0.000000690882 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  26.83 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02905  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.05 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  29.06 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2898  aminotransferase, class IV  27.61 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.051905 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1418  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  29.34 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.711679 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1611  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.11 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  27.46 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1626  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.32 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  28.3 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  25.84 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.22 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  25.9 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  29.44 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  25.31 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  25.73 
 
 
298 aa  79  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  25.69 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  25.73 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  25.73 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  25.73 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  25.73 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  25.73 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  25.73 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  25.73 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  25.73 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1545  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  28.43 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.185803  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  27.43 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  29.05 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3708  aminotransferase, class IV  30.46 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464528  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  28.3 
 
 
295 aa  77  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.17 
 
 
292 aa  77  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  24.48 
 
 
299 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1015  aminotransferase class IV  28.23 
 
 
309 aa  77  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  26.75 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  26.64 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  28.4 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>