More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_18841 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_18841  aminotransferases class-IV  100 
 
 
275 aa  547  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1786  aminotransferase class-IV  64 
 
 
275 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.285091  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19031  aminotransferases class-IV  65.09 
 
 
275 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35016  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18841  aminotransferases class-IV  64.73 
 
 
275 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21671  aminotransferases class-IV  46.62 
 
 
275 aa  231  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.221172 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1295  aminotransferase class-IV  46.24 
 
 
275 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.326181  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18261  aminotransferase class-IV  43.22 
 
 
276 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29691  aminotransferases class-IV  36.67 
 
 
286 aa  202  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2240  aminotransferase class IV  34.91 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2604  aminotransferase class IV  35.64 
 
 
270 aa  192  4e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.946338  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  27.89 
 
 
264 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  26.58 
 
 
282 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2898  aminotransferase, class IV  24.88 
 
 
270 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.051905 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  25.36 
 
 
287 aa  88.6  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.59 
 
 
292 aa  87.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  23.4 
 
 
283 aa  85.9  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  30.71 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  30.71 
 
 
287 aa  82  0.000000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  26.11 
 
 
274 aa  82  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  24.63 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  27.32 
 
 
298 aa  79  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  23.48 
 
 
269 aa  78.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  26.42 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  26.14 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  25.45 
 
 
288 aa  77  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  24.88 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  25.57 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  27.35 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  27.35 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  27.35 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  27.35 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  27.35 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  26.13 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  26.94 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  26.94 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  26.94 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  26.94 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  27.76 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  22.86 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  23.57 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  22.35 
 
 
288 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  26.09 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1636  aminotransferase class IV  23.64 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1273  putative branched-chain amino acid aminotransferase  32.83 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  28.82 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  23.53 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  24.19 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  26.51 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  24.53 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  23.19 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1095  branched-chain amino acid aminotransferase, putative  32.83 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0167966  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  23.53 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15470  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  21.37 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0160772  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  26.91 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  20.74 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  26.34 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0616  aminotransferase, class IV  29.83 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.27072  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  27.14 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  22.17 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1220  aminotransferase class IV  25.11 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  23.05 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1864  aminodeoxychorismate lyase  24.76 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.358986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  27.59 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4377  aminotransferase class IV  22.99 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.505275  normal  0.583274 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  24.89 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  25.94 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  23.17 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  26.05 
 
 
292 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  24.6 
 
 
293 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  23.36 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.6 
 
 
290 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  26.6 
 
 
288 aa  63.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0051  aminotransferase class IV  22.01 
 
 
279 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  23.46 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  26.41 
 
 
271 aa  63.5  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  23.69 
 
 
295 aa  63.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  22.43 
 
 
288 aa  63.2  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  27.35 
 
 
288 aa  62.4  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1302  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  21.3 
 
 
272 aa  62.4  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0291575  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  23.96 
 
 
297 aa  62.4  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  20.44 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0953  aminotransferase class IV  25.24 
 
 
288 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  25.97 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  25.69 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  24.3 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.1 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  25.11 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  24.7 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  24.7 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  24.7 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  24.7 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5707  aminotransferase class IV  23.11 
 
 
281 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  24.7 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  21.4 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  24.75 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  25.11 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.14 
 
 
290 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  23.75 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  24.52 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  21.8 
 
 
285 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>