More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0953 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0953  aminotransferase class IV  100 
 
 		 288 aa  575  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3571  aminotransferase class IV  58.18 
 
 		 290 aa  301  7.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.210184  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1639  4-amino-4-deoxychorismate lyase  52.92 
 
 		 293 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4535  4-amino-4-deoxychorismate lyase  54.48 
 
 		 292 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4622  4-amino-4-deoxychorismate lyase  54.48 
 
 		 292 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4918  4-amino-4-deoxychorismate lyase  54.14 
 
 		 292 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5108  4-amino-4-deoxychorismate lyase  52.23 
 
 		 293 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10827  4-amino-4-deoxychorismate lyase  50.17 
 
 		 295 aa  261  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0391941 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37740  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  44.09 
 
 		 282 aa  231  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.341981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6835  aminotransferase class IV  47.21 
 
 		 280 aa  222  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5028  aminotransferase class IV  46.07 
 
 		 281 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3637  4-amino-4-deoxychorismate lyase  44.13 
 
 		 309 aa  202  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3850  4-amino-4-deoxychorismate lyase  40.48 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  46.18 
 
 		 289 aa  183  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5707  aminotransferase class IV  39.47 
 
 		 281 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03810  4-amino-4-deoxychorismate lyase  40.47 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0374  aminotransferase class IV  38.52 
 
 		 287 aa  148  8e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0311  aminotransferase, class IV  37.64 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18900  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  40.3 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3389  aminotransferase, class IV  39.25 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  30.2 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  29.82 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  31.37 
 
 		 284 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.57 
 
 		 277 aa  85.9  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  31.84 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  30.29 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2604  aminotransferase class IV  31.92 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.946338  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  32.35 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  27.41 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0188  aminotransferase class IV  34.7 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  32.21 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  27.41 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  27.41 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  27.41 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  27.41 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  26.02 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  29.17 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  33.19 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  26.53 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  27.04 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  27.04 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  27.04 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  27.04 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.43 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  25.77 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  29.47 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  26.74 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  31.75 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  24.89 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  25.38 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  27.49 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  33.65 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  28.87 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  28.57 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  32.46 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  28.41 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0716  aminotransferase, class IV  24.31 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0327665  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  27.09 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  27.06 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  25.1 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  27.63 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  31.71 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3708  aminotransferase, class IV  29.08 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464528  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  23.63 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  23.63 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  30.26 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  26.25 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  34.15 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1655  D-amino acid aminotransferase  25.74 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405674  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  25.32 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  29.38 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  25.32 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  23.95 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1295  aminotransferase class-IV  24.54 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.326181  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  28.62 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  33.07 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  26.69 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  25.38 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  25.79 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  26.32 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  26.85 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  23.63 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  25 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  23.63 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  24.47 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  32.61 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  32.23 
 
 		 278 aa  72  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  30.86 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  28.4 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01083  D-alanine transaminase  24.06 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  25.48 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  26.1 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  25.76 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3562  aminotransferase class IV  27.73 
 
 		 283 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  32.68 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  24.59 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  25.87 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  28.23 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  24.22 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21671  aminotransferases class-IV  24.18 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.221172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>