More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3850 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3850  4-amino-4-deoxychorismate lyase  100 
 
 		 312 aa  626  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3637  4-amino-4-deoxychorismate lyase  76.14 
 
 		 309 aa  467  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5028  aminotransferase class IV  45.86 
 
 		 281 aa  222  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37740  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  45.85 
 
 		 282 aa  222  7e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.341981 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18900  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  51.16 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3571  aminotransferase class IV  46.53 
 
 		 290 aa  210  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.210184  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10827  4-amino-4-deoxychorismate lyase  45.79 
 
 		 295 aa  208  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0391941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1639  4-amino-4-deoxychorismate lyase  45.05 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6835  aminotransferase class IV  45.26 
 
 		 280 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  48.12 
 
 		 289 aa  196  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5108  4-amino-4-deoxychorismate lyase  43.45 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0953  aminotransferase class IV  40.48 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4918  4-amino-4-deoxychorismate lyase  45.19 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4622  4-amino-4-deoxychorismate lyase  44.81 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4535  4-amino-4-deoxychorismate lyase  44.81 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5707  aminotransferase class IV  39.63 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03810  4-amino-4-deoxychorismate lyase  41.53 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0374  aminotransferase class IV  36.73 
 
 		 287 aa  143  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0311  aminotransferase, class IV  37.55 
 
 		 288 aa  142  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  30.56 
 
 		 291 aa  115  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3389  aminotransferase, class IV  35.63 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  27.01 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  27.46 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  32.74 
 
 		 278 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  27.36 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  30.52 
 
 		 280 aa  89  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  26.82 
 
 		 286 aa  88.2  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  30.61 
 
 		 286 aa  87.4  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0188  aminotransferase class IV  31.15 
 
 		 276 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  30 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  26.13 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  29.86 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  26.32 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  25.41 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  27.46 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  29.97 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.62 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  31.1 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  28.06 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  29.54 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  24.5 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  24.91 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  26.57 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  27.18 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  25.5 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  26.14 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  28.9 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  25.26 
 
 		 288 aa  79  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  25.16 
 
 		 287 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  26.06 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  24.48 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  29.24 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  26.47 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  24.64 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  26.64 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  25.7 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  23.51 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  26.47 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  26.67 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  26.58 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  24.03 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  24.38 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  24.38 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  24.38 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  25.08 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  24.38 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  28.03 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  24.38 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  26.48 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  23.51 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  30.08 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  24.03 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  24.03 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  30.42 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  24.03 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  24.03 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  25.17 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  24.91 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  23.43 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  27.97 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  26.38 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  26.06 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  23.68 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  23.68 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  23.68 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  23.68 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  25.81 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  23.68 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  23.68 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  25.7 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15470  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.01 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0160772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  23.68 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  23.84 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  23.36 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  23.76 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  29.96 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  29 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  23.36 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  26.32 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.97 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>