More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1639 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1639  4-amino-4-deoxychorismate lyase  100 
 
 
293 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5108  4-amino-4-deoxychorismate lyase  86.01 
 
 
293 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4918  4-amino-4-deoxychorismate lyase  75.43 
 
 
292 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4535  4-amino-4-deoxychorismate lyase  75.43 
 
 
292 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4622  4-amino-4-deoxychorismate lyase  75.43 
 
 
292 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10827  4-amino-4-deoxychorismate lyase  70.17 
 
 
295 aa  413  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0391941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0953  aminotransferase class IV  52.92 
 
 
288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3571  aminotransferase class IV  53.42 
 
 
290 aa  272  5.000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.210184  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5028  aminotransferase class IV  49.3 
 
 
281 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37740  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  48.88 
 
 
282 aa  237  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6835  aminotransferase class IV  49.63 
 
 
280 aa  229  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3637  4-amino-4-deoxychorismate lyase  45.74 
 
 
309 aa  212  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3850  4-amino-4-deoxychorismate lyase  45.05 
 
 
312 aa  193  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5707  aminotransferase class IV  42.45 
 
 
281 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  45.49 
 
 
289 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03810  4-amino-4-deoxychorismate lyase  41.67 
 
 
299 aa  166  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0374  aminotransferase class IV  38.46 
 
 
287 aa  159  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18900  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  46.53 
 
 
333 aa  158  8e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0311  aminotransferase, class IV  39.62 
 
 
288 aa  155  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3389  aminotransferase, class IV  39.39 
 
 
289 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  31.88 
 
 
291 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  27.59 
 
 
292 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  25.99 
 
 
297 aa  89  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  25.38 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  28.83 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  27.11 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.52 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  28.67 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  27.52 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  30.4 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  24.45 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  25.18 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  31.58 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  30.21 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  30.08 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  24.91 
 
 
293 aa  79  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  25.91 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0188  aminotransferase class IV  32.09 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  28.24 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  25.98 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.9 
 
 
292 aa  77  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  29.26 
 
 
298 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  24.63 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  24.91 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  26.57 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  26.09 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  26.71 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  24.72 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  24.72 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  24.72 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  24.72 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  23.98 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  24.72 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  24.72 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  23.98 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  23.98 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  24.72 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  28.78 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1502  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  28.81 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0156373  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  24.72 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  24.72 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  25.68 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  23.58 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  23.58 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  28.29 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  23.91 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  23.44 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0329  aminotransferase, class IV  28.37 
 
 
315 aa  72.4  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  31.37 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  23.58 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  23.99 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  23.55 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  23.72 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  26.17 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  26.32 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  23.55 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  25.74 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  26.14 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  28.74 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  26.01 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  26.1 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2275  aminotransferase class IV  32 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.337005  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  22.76 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  22.89 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  25.18 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  23.58 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  25.63 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  28.21 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  34.13 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  23.94 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  26.15 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  22.34 
 
 
293 aa  68.9  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  25.64 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  24.28 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  32.55 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  24.58 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  27 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  26.15 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  26.29 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5405  D-amino acid aminotransferase  24.58 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000087817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>