More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10827 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10827  4-amino-4-deoxychorismate lyase  100 
 
 
295 aa  585  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0391941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1639  4-amino-4-deoxychorismate lyase  70.17 
 
 
293 aa  413  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4535  4-amino-4-deoxychorismate lyase  70.17 
 
 
292 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4622  4-amino-4-deoxychorismate lyase  70.17 
 
 
292 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4918  4-amino-4-deoxychorismate lyase  70.17 
 
 
292 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5108  4-amino-4-deoxychorismate lyase  67.12 
 
 
293 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0953  aminotransferase class IV  50.17 
 
 
288 aa  261  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3571  aminotransferase class IV  51.74 
 
 
290 aa  253  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.210184  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37740  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  43.51 
 
 
282 aa  217  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341981 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3637  4-amino-4-deoxychorismate lyase  44.72 
 
 
309 aa  209  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6835  aminotransferase class IV  44.44 
 
 
280 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5028  aminotransferase class IV  46.24 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3850  4-amino-4-deoxychorismate lyase  45.79 
 
 
312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5707  aminotransferase class IV  43.38 
 
 
281 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03810  4-amino-4-deoxychorismate lyase  42.31 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  41.73 
 
 
289 aa  161  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0374  aminotransferase class IV  38.32 
 
 
287 aa  158  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0311  aminotransferase, class IV  39.69 
 
 
288 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18900  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  41.97 
 
 
333 aa  136  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3389  aminotransferase, class IV  39.31 
 
 
289 aa  109  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  28.25 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  26.28 
 
 
292 aa  89.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  29.5 
 
 
286 aa  87  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  25.94 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  26.33 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  23.99 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  25 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  28.83 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  26.44 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  23.81 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  27.11 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  23.97 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  26.86 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  23.08 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  23.96 
 
 
287 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  27.34 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  24.57 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  25.75 
 
 
293 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0188  aminotransferase class IV  31.5 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  22.94 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  25.96 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  24 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  31.27 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.62 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  25.18 
 
 
289 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  24.83 
 
 
293 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  24 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  25.27 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  23.45 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  30.86 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  26.35 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  24.9 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  25.09 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.65 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  23.99 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  25.45 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  25.45 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  29.31 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  25.09 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  25.09 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  25.09 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  25.09 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  24.37 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  24.91 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  25.09 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  26.72 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  25.09 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  25 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  25.27 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  24.91 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  24.91 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  24.91 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  24.91 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  25.55 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  24.91 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  24.91 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  24.91 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  26.14 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  24.91 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  27.56 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  25 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  26.17 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  25.74 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  26.13 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  29.74 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  26.89 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  24.81 
 
 
298 aa  68.9  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  25.19 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  27.47 
 
 
294 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  25.82 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  24.36 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  24.18 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  25.9 
 
 
285 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  25.75 
 
 
282 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  28.83 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  25.82 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  28.42 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  21.76 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2604  aminotransferase class IV  32.5 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.946338  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  21.76 
 
 
291 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>