More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3389 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3389  aminotransferase, class IV  100 
 
 		 289 aa  544  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0374  aminotransferase class IV  43.82 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5707  aminotransferase class IV  39.49 
 
 		 281 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0311  aminotransferase, class IV  41.43 
 
 		 288 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6835  aminotransferase class IV  39.35 
 
 		 280 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3571  aminotransferase class IV  40 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.210184  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0953  aminotransferase class IV  39.25 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03810  4-amino-4-deoxychorismate lyase  40.23 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37740  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.9 
 
 		 282 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.341981 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10827  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.31 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0391941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4918  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.91 
 
 		 292 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1639  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.39 
 
 		 293 aa  105  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  40.94 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5108  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.15 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4535  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.52 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4622  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.52 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  36.86 
 
 		 261 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18900  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  46.67 
 
 		 333 aa  96.3  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5028  aminotransferase class IV  38.87 
 
 		 281 aa  95.9  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3850  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.63 
 
 		 312 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3637  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.55 
 
 		 309 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0188  aminotransferase class IV  36.78 
 
 		 276 aa  92.4  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  27.51 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  36.51 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  29.96 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1339  aminotransferase class IV  23.29 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  33.09 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1015  aminotransferase class IV  30.24 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  26.71 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  27.95 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  30.74 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  27.95 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  29.89 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  35.63 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  31.54 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02332  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.4 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  31.14 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  34.77 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  32.27 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  30.15 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2240  aminotransferase class IV  32.02 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  32.54 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  31.73 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  30.18 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1095  branched-chain amino acid aminotransferase, putative  23.5 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0167966  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  28.83 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2269  aminotransferase class IV  26.24 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.4966  normal  0.194503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  28.96 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  28.46 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01083  D-alanine transaminase  23.19 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  28.19 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.3 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  29.46 
 
 		 629 aa  63.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  27.78 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  31.22 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  28.68 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  35.71 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  27.45 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  31.62 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  25.81 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  28.85 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  24.74 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  33.33 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  28.62 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3708  aminotransferase, class IV  32.05 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  26.67 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  35.18 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1273  putative branched-chain amino acid aminotransferase  24.34 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.68 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  28.26 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  28.69 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0412  aminotransferase class IV  25.28 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11828  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  33.8 
 
 		 623 aa  60.1  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1476  D-amino acid aminotransferase  25 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  28.41 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  27.84 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  32.68 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.67 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2604  aminotransferase class IV  34.63 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.946338  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.68 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  25.38 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  28.9 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  31.02 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  29.3 
 
 		 618 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  25.75 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  25.75 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  22.13 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  26.05 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  30.38 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2783  Para-aminobenzoate synthase, component I  31.65 
 
 		 595 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.688281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3767  D-amino acid aminotransferase  23.55 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140318  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0976  branched-chain amino acid aminotransferase family protein  31.27 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167546  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  31.35 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  30.57 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0651  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.63 
 
 		 629 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  26.47 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  29.61 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2216  aminotransferase class IV  23.94 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.556361  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2898  aminotransferase, class IV  30.8 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.051905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1919  branched-chain amino acid aminotransferase  28.33 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.451935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>