More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4082 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  100 
 
 		 289 aa  555  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3637  4-amino-4-deoxychorismate lyase  50.17 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03810  4-amino-4-deoxychorismate lyase  49.25 
 
 		 299 aa  219  6e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6835  aminotransferase class IV  49.81 
 
 		 280 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37740  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  48.62 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.341981 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3850  4-amino-4-deoxychorismate lyase  49.25 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0953  aminotransferase class IV  46.95 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5028  aminotransferase class IV  46.89 
 
 		 281 aa  187  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1639  4-amino-4-deoxychorismate lyase  47.74 
 
 		 293 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4622  4-amino-4-deoxychorismate lyase  45.32 
 
 		 292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4535  4-amino-4-deoxychorismate lyase  45.32 
 
 		 292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3571  aminotransferase class IV  47.27 
 
 		 290 aa  179  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.210184  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4918  4-amino-4-deoxychorismate lyase  45.32 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5108  4-amino-4-deoxychorismate lyase  45.49 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5707  aminotransferase class IV  41.87 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10827  4-amino-4-deoxychorismate lyase  43.8 
 
 		 295 aa  171  9e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0391941 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18900  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  47.52 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0374  aminotransferase class IV  39.68 
 
 		 287 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0311  aminotransferase, class IV  38.87 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3389  aminotransferase, class IV  40.94 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  32.3 
 
 		 276 aa  97.1  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  31.95 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  35.46 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  35.38 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  29.59 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  33.08 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0188  aminotransferase class IV  34.73 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  32.83 
 
 		 280 aa  87  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  33.09 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2744  aminotransferase class IV  34.18 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  32.05 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  34.29 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  30.07 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  27.8 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  33.85 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1295  aminotransferase class-IV  23.74 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.326181  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2654  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  33.09 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  32.8 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2839  aminotransferase class IV  33.82 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0464301  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  26.72 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  34.21 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  25.65 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  25.65 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  29.07 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  25.65 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21671  aminotransferases class-IV  23.74 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.221172 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  25.65 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  25.65 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  25.65 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  25.65 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  25.65 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  25.65 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  25.65 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  27.13 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  27.4 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  35.89 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  28.57 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  27.94 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15470  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.33 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0160772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.24 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  33.61 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  26.46 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  25.47 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  30.2 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2277  aminotransferase, class IV  29.93 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2892  aminotransferase, class IV  29.93 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.2 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2902  aminotransferase class IV  29.93 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1502  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  29.96 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0156373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1636  aminotransferase class IV  31.89 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2942  aminotransferase, class IV  30.43 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  25.78 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  28.63 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2604  aminotransferase class IV  28.29 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.946338  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  31.56 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1476  D-amino acid aminotransferase  28.24 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3708  aminotransferase, class IV  28.62 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  30.56 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2804  aminotransferase class IV  29.35 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  27.92 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  26.29 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  26.38 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  25.98 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  24.12 
 
 		 293 aa  65.5  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  25.08 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  26.48 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.05 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  26.84 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  27.59 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2240  aminotransferase class IV  27.63 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  25.77 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0412  aminotransferase class IV  29.09 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11828  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3207  aminotransferase, class IV  28.03 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1092  aminotransferase, class IV  23.48 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0381  D-amino acid aminotransferase  29.96 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  25.86 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  24.81 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0716  aminotransferase, class IV  25.1 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0327665  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  25.69 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>