More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0374 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0374  aminotransferase class IV  100 
 
 
287 aa  557  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0311  aminotransferase, class IV  83.81 
 
 
288 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5707  aminotransferase class IV  50.36 
 
 
281 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4918  4-amino-4-deoxychorismate lyase  42.4 
 
 
292 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3571  aminotransferase class IV  41.44 
 
 
290 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.210184  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1639  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.46 
 
 
293 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4535  4-amino-4-deoxychorismate lyase  42 
 
 
292 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4622  4-amino-4-deoxychorismate lyase  42 
 
 
292 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10827  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.32 
 
 
295 aa  158  8e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0391941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6835  aminotransferase class IV  40.15 
 
 
280 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5108  4-amino-4-deoxychorismate lyase  40.56 
 
 
293 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0953  aminotransferase class IV  38.52 
 
 
288 aa  148  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37740  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.78 
 
 
282 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341981 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3850  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.73 
 
 
312 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3389  aminotransferase, class IV  43.82 
 
 
289 aa  135  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3637  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.32 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5028  aminotransferase class IV  36.64 
 
 
281 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.68 
 
 
289 aa  125  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03810  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.94 
 
 
299 aa  123  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18900  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  41.07 
 
 
333 aa  104  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  32.13 
 
 
291 aa  102  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  33.47 
 
 
294 aa  99  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  33.97 
 
 
261 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3767  D-amino acid aminotransferase  27.2 
 
 
290 aa  94.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140318  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0188  aminotransferase class IV  34.09 
 
 
276 aa  92.8  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  29.5 
 
 
297 aa  91.3  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  27.57 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  27.57 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  27.57 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5405  D-amino acid aminotransferase  27.57 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000087817  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  27.57 
 
 
290 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  27.86 
 
 
300 aa  89.7  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  26.47 
 
 
290 aa  89.7  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5082  D-amino acid aminotransferase  27.57 
 
 
294 aa  89.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  27.34 
 
 
291 aa  89.4  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 
298 aa  89.4  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 
298 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 
298 aa  89.4  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5472  D-amino acid aminotransferase  27.57 
 
 
290 aa  89.4  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00355566  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 
298 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  26.12 
 
 
293 aa  89  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  27.76 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  27.76 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  24.21 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  24.21 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  24.21 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  27.76 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  27.57 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  27.76 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  27.47 
 
 
282 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  33.73 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  25.1 
 
 
291 aa  87  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  27.6 
 
 
300 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  23.81 
 
 
291 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  23.81 
 
 
291 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  31.02 
 
 
298 aa  86.7  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  27.16 
 
 
290 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  24.6 
 
 
291 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  27.31 
 
 
293 aa  85.9  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  26.42 
 
 
299 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  26.95 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  26.4 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  28.46 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  25.57 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.63 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  28.46 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  26.94 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  24.27 
 
 
291 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  27.13 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  25.71 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  27.05 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  27.95 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  24.51 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  28.06 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  28.86 
 
 
290 aa  82  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  27.99 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  26.05 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  25.51 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  24.69 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  23.21 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  28.36 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  30.19 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1655  D-amino acid aminotransferase  23.49 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.21 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.61 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  27.41 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1998  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.24 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  24.9 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.31 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  24.9 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.31 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  24.9 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  24.9 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.1 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  31.91 
 
 
285 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.31 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  24.9 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  26.61 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0079  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.31 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>