More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5108 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5108  4-amino-4-deoxychorismate lyase  100 
 
 
293 aa  580  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1639  4-amino-4-deoxychorismate lyase  86.01 
 
 
293 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4918  4-amino-4-deoxychorismate lyase  75.09 
 
 
292 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4535  4-amino-4-deoxychorismate lyase  75.43 
 
 
292 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4622  4-amino-4-deoxychorismate lyase  75.43 
 
 
292 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10827  4-amino-4-deoxychorismate lyase  67.12 
 
 
295 aa  393  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0391941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0953  aminotransferase class IV  52.23 
 
 
288 aa  269  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3571  aminotransferase class IV  53.77 
 
 
290 aa  268  7e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.210184  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37740  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  47.21 
 
 
282 aa  223  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341981 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5028  aminotransferase class IV  47.9 
 
 
281 aa  221  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6835  aminotransferase class IV  47.57 
 
 
280 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3637  4-amino-4-deoxychorismate lyase  43.62 
 
 
309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3850  4-amino-4-deoxychorismate lyase  43.45 
 
 
312 aa  185  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5707  aminotransferase class IV  41.37 
 
 
281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  44.71 
 
 
289 aa  169  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03810  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.78 
 
 
299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0374  aminotransferase class IV  40.56 
 
 
287 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0311  aminotransferase, class IV  40.8 
 
 
288 aa  149  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18900  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  43.15 
 
 
333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3389  aminotransferase, class IV  39.15 
 
 
289 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  27.8 
 
 
292 aa  99  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  30.34 
 
 
291 aa  98.2  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  26.09 
 
 
297 aa  93.2  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  30.82 
 
 
274 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  25.09 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  30.83 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  30.07 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  25.37 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  26.28 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  24.62 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  26.91 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  26.26 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  27.97 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  30.91 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  28.51 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  31.39 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  29.58 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  25.48 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0188  aminotransferase class IV  30.74 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  25.62 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  26.84 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  26.77 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  24.45 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  24.36 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  24.82 
 
 
298 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  24.82 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  24.82 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  24.82 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  24.82 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  24.82 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  24.82 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  26.95 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  24.82 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  24.82 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0329  aminotransferase, class IV  28.42 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  28.62 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  33.33 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  27.91 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  29.04 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  27.47 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  25.29 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.39 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  24.71 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  25.72 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  30.58 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  27.78 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  26.36 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  27.27 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  23.95 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  23.95 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  25.78 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  26.81 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  25.27 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  23.95 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  23.95 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  23.99 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  23.95 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  23.95 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  23.95 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  26.03 
 
 
347 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  23.95 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  23.1 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.27 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  23.95 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  27.78 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  25.77 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0255  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  26.39 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1502  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  25.98 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0156373  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  24.91 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  23.68 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  23.36 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  30.88 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  28.06 
 
 
294 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  26.92 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2654  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  29.66 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  26.04 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  22.36 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  22.3 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  22.36 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  22.36 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>