More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3571 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3571  aminotransferase class IV  100 
 
 		 290 aa  572  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.210184  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0953  aminotransferase class IV  58.18 
 
 		 288 aa  301  8.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1639  4-amino-4-deoxychorismate lyase  53.42 
 
 		 293 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4535  4-amino-4-deoxychorismate lyase  55.59 
 
 		 292 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4622  4-amino-4-deoxychorismate lyase  55.59 
 
 		 292 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5108  4-amino-4-deoxychorismate lyase  53.77 
 
 		 293 aa  268  7e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4918  4-amino-4-deoxychorismate lyase  54.55 
 
 		 292 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10827  4-amino-4-deoxychorismate lyase  51.74 
 
 		 295 aa  253  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0391941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6835  aminotransferase class IV  52.06 
 
 		 280 aa  247  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37740  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  50.75 
 
 		 282 aa  238  8e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.341981 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5028  aminotransferase class IV  48.07 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3637  4-amino-4-deoxychorismate lyase  46.85 
 
 		 309 aa  205  6e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5707  aminotransferase class IV  43.17 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3850  4-amino-4-deoxychorismate lyase  46.53 
 
 		 312 aa  199  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0311  aminotransferase, class IV  42.59 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  46.27 
 
 		 289 aa  168  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0374  aminotransferase class IV  41.44 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03810  4-amino-4-deoxychorismate lyase  42.41 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18900  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  42.61 
 
 		 333 aa  129  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3389  aminotransferase, class IV  40 
 
 		 289 aa  123  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  30.22 
 
 		 291 aa  96.3  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  39.11 
 
 		 261 aa  92.8  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  33.33 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  29.55 
 
 		 297 aa  89.4  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  33.6 
 
 		 288 aa  87.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  32.43 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  35.65 
 
 		 274 aa  86.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  30.04 
 
 		 288 aa  86.7  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  27.37 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  25.85 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0329  aminotransferase, class IV  31.12 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0188  aminotransferase class IV  31.48 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  27.61 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  27.37 
 
 		 276 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  31.46 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.03 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2240  aminotransferase class IV  30.34 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  27.4 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  28.74 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  26.15 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  30.92 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  28.85 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  29.57 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.07 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  27.68 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  32.58 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  25.89 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  25.09 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  32.58 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1295  aminotransferase class-IV  23.74 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.326181  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  28.46 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  26.94 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21671  aminotransferases class-IV  25.76 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.221172 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  25.18 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01083  D-alanine transaminase  25.56 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  29.85 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3708  aminotransferase, class IV  28.88 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  25.96 
 
 		 300 aa  75.5  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  26.26 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  23.94 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  23.61 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2275  aminotransferase class IV  31.58 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.337005  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  24.65 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  24.82 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  35.35 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2277  aminotransferase, class IV  27.51 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2892  aminotransferase, class IV  27.51 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  27.53 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2902  aminotransferase class IV  27.51 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393728  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  25.83 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  26.43 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  24.91 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0051  aminotransferase class IV  31.79 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  25.83 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  25.83 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  25.83 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  25.83 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1418  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  29.54 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711679 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  31.96 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  24.47 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  25.46 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  23.76 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.87 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  25.46 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  30.88 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2804  aminotransferase class IV  26.77 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  23.67 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0057  D-amino acid aminotransferase  27.41 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0621  D-amino acid aminotransferase  27.41 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0223  D-amino acid aminotransferase  27.41 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0716  aminotransferase, class IV  25.94 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0327665  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1636  aminotransferase class IV  32.4 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3191  D-amino acid aminotransferase  27.41 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1255  aminodeoxychorismate lyase  28.38 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  25.46 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0439  putative D-amino acid aminotransferase  27.41 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0459  putative D-amino acid aminotransferase  27.41 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1370  D-amino acid aminotransferase  27.41 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  25.46 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1015  aminotransferase class IV  28.85 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>