More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5707 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5707  aminotransferase class IV  100 
 
 
281 aa  565  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0311  aminotransferase, class IV  50.55 
 
 
288 aa  264  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0374  aminotransferase class IV  50.36 
 
 
287 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3571  aminotransferase class IV  43.17 
 
 
290 aa  203  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.210184  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4535  4-amino-4-deoxychorismate lyase  43.17 
 
 
292 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4622  4-amino-4-deoxychorismate lyase  43.17 
 
 
292 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5028  aminotransferase class IV  41.45 
 
 
281 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4918  4-amino-4-deoxychorismate lyase  43.17 
 
 
292 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1639  4-amino-4-deoxychorismate lyase  42.45 
 
 
293 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10827  4-amino-4-deoxychorismate lyase  43.38 
 
 
295 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0391941 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03810  4-amino-4-deoxychorismate lyase  42.46 
 
 
299 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37740  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  40 
 
 
282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5108  4-amino-4-deoxychorismate lyase  41.37 
 
 
293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3637  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.97 
 
 
309 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3850  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.63 
 
 
312 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6835  aminotransferase class IV  40.51 
 
 
280 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0953  aminotransferase class IV  39.47 
 
 
288 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  41.87 
 
 
289 aa  172  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18900  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  44.49 
 
 
333 aa  152  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3389  aminotransferase, class IV  39.49 
 
 
289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  29.41 
 
 
291 aa  98.6  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.86 
 
 
292 aa  95.5  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  31.46 
 
 
261 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0188  aminotransferase class IV  32.94 
 
 
276 aa  92.8  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  31.41 
 
 
280 aa  92  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  32.73 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  29.34 
 
 
282 aa  89  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1383  aminotransferase class IV  31.65 
 
 
276 aa  89  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.0488839 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1015  aminotransferase class IV  31.06 
 
 
309 aa  89  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  28.68 
 
 
281 aa  87  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  28.62 
 
 
284 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  30.71 
 
 
285 aa  85.9  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  28.62 
 
 
274 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  27.88 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  27.64 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0412  aminotransferase class IV  31.18 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11828  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  32.19 
 
 
283 aa  79  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  25 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  26.18 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0976  branched-chain amino acid aminotransferase family protein  29.62 
 
 
278 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  26.34 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.61 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  25.45 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0179  aminotransferase class IV  25.71 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.613423  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  27.24 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3767  D-amino acid aminotransferase  25.45 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140318  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  28.21 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  29.77 
 
 
280 aa  77  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.79 
 
 
277 aa  77  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  27.11 
 
 
277 aa  77  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  30.51 
 
 
280 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15470  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.37 
 
 
313 aa  77  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0160772  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  28.21 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1255  aminodeoxychorismate lyase  28 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489867  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1418  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  30.3 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.711679 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  26.34 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  24.61 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  24.59 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  24.5 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  26.34 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  26.34 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  26.34 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  25.09 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  26.34 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2216  aminotransferase class IV  23.2 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.556361  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  24.28 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  28.94 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  25.93 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  25.93 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  25.49 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  25.93 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  25.49 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1528  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.02 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  25.49 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1650  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.23 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159709  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  26.69 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  26.83 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  25.49 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  26.16 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  25.1 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  26.72 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  25.93 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.77 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  28.24 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5405  D-amino acid aminotransferase  25.32 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000087817  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  26.92 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  25.19 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.49 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.49 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0079  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.49 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128474 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.49 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  27.1 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  25.51 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1998  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.13 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  30.99 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5082  D-amino acid aminotransferase  25.1 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5472  D-amino acid aminotransferase  25.1 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00355566  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3829  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.94 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.92 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.66 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>