More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4918 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4918  4-amino-4-deoxychorismate lyase  100 
 
 
292 aa  573  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4535  4-amino-4-deoxychorismate lyase  98.63 
 
 
292 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4622  4-amino-4-deoxychorismate lyase  98.63 
 
 
292 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1639  4-amino-4-deoxychorismate lyase  75.43 
 
 
293 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5108  4-amino-4-deoxychorismate lyase  75.09 
 
 
293 aa  435  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10827  4-amino-4-deoxychorismate lyase  70.17 
 
 
295 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0391941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0953  aminotransferase class IV  54.14 
 
 
288 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3571  aminotransferase class IV  54.55 
 
 
290 aa  263  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.210184  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5028  aminotransferase class IV  48.95 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6835  aminotransferase class IV  47 
 
 
280 aa  212  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37740  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  45.9 
 
 
282 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341981 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3637  4-amino-4-deoxychorismate lyase  44.68 
 
 
309 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5707  aminotransferase class IV  43.17 
 
 
281 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3850  4-amino-4-deoxychorismate lyase  45.19 
 
 
312 aa  181  9.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  44.93 
 
 
289 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0374  aminotransferase class IV  42.4 
 
 
287 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03810  4-amino-4-deoxychorismate lyase  42.28 
 
 
299 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0311  aminotransferase, class IV  40.4 
 
 
288 aa  149  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18900  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  44.29 
 
 
333 aa  145  7.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3389  aminotransferase, class IV  38.91 
 
 
289 aa  106  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  28.83 
 
 
291 aa  97.1  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  26.74 
 
 
292 aa  92  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  28.73 
 
 
277 aa  87  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  32.58 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  26.37 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  28.11 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  31.37 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  25.96 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  26.32 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0329  aminotransferase, class IV  28.83 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  30.12 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  27.34 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  30.15 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  30.3 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.81 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  23.86 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  26.88 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  28.88 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  26.06 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  26.78 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0188  aminotransferase class IV  33.64 
 
 
276 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  26.83 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  26.22 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  25.84 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  25.84 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  24.25 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  26.02 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  25.84 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  26.02 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  25.84 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  25.84 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  25.84 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  25.84 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  27.78 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  23.05 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  26.59 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  24.25 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6235  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.33 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.513933 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  23.88 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0057  D-amino acid aminotransferase  30.24 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0439  putative D-amino acid aminotransferase  30.24 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3191  D-amino acid aminotransferase  30.24 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0621  D-amino acid aminotransferase  30.24 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0255  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  25.7 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  27.93 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  25.41 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0459  putative D-amino acid aminotransferase  30.24 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1370  D-amino acid aminotransferase  30.24 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0223  D-amino acid aminotransferase  30.24 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  27.3 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  27.68 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  29.77 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  24.07 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  27.68 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  22.05 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  25.46 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  24.82 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  31.5 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  25.75 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  23.88 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  23.61 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  25.61 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  27.46 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  27.21 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1295  aminotransferase class-IV  26.5 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.326181  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21671  aminotransferases class-IV  27 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.221172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1502  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  26.69 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0156373  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  22.59 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.03 
 
 
292 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  24.06 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  25.84 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  30.6 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  21.83 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  28.36 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  26.1 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  23.88 
 
 
281 aa  67  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  22.98 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2240  aminotransferase class IV  29.21 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0381  D-amino acid aminotransferase  28.87 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  22.98 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>