More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4535 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4535  4-amino-4-deoxychorismate lyase  100 
 
 		 292 aa  574  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4622  4-amino-4-deoxychorismate lyase  100 
 
 		 292 aa  574  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4918  4-amino-4-deoxychorismate lyase  98.63 
 
 		 292 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1639  4-amino-4-deoxychorismate lyase  75.43 
 
 		 293 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5108  4-amino-4-deoxychorismate lyase  75.43 
 
 		 293 aa  436  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10827  4-amino-4-deoxychorismate lyase  70.17 
 
 		 295 aa  402  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0391941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0953  aminotransferase class IV  54.48 
 
 		 288 aa  273  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3571  aminotransferase class IV  55.59 
 
 		 290 aa  270  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.210184  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5028  aminotransferase class IV  48.95 
 
 		 281 aa  216  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37740  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  46.64 
 
 		 282 aa  216  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.341981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6835  aminotransferase class IV  47 
 
 		 280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3637  4-amino-4-deoxychorismate lyase  44.33 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5707  aminotransferase class IV  43.17 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3850  4-amino-4-deoxychorismate lyase  44.81 
 
 		 312 aa  182  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  44.93 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03810  4-amino-4-deoxychorismate lyase  42.53 
 
 		 299 aa  159  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0374  aminotransferase class IV  42 
 
 		 287 aa  159  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0311  aminotransferase, class IV  40 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18900  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  43.94 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3389  aminotransferase, class IV  38.52 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  29.56 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  26.39 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  28.42 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  31.5 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  26.01 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  28.11 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  30.51 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  31.37 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  25.96 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  26.46 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0329  aminotransferase, class IV  28.83 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  28.12 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  28.15 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  29.12 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  31.44 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.81 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0188  aminotransferase class IV  33.64 
 
 		 276 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  24.13 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  27.46 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  26.83 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  24.75 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  24.75 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.47 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  25.75 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  29.76 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  24.51 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  26.88 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  29.1 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  28.81 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6235  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.33 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.513933 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  25.37 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  22.83 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  25.56 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  25.56 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  25.37 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1295  aminotransferase class-IV  26.5 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.326181  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  28.28 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  23.51 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  26.02 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21671  aminotransferases class-IV  27 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.221172 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  25.37 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  25.65 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  25.65 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  25.65 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  25.65 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  23.88 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1502  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  26.59 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0156373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0439  putative D-amino acid aminotransferase  30.24 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  24.36 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0057  D-amino acid aminotransferase  30.24 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0621  D-amino acid aminotransferase  30.24 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3191  D-amino acid aminotransferase  30.24 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0459  putative D-amino acid aminotransferase  30.24 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1370  D-amino acid aminotransferase  30.24 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0223  D-amino acid aminotransferase  30.24 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  31.5 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  27.54 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  21.83 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  27.46 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  27.68 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  26.19 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  25.75 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  25.46 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  24.82 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  25.08 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  23.26 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  27.21 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  23.39 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  31.25 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  23.39 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  23.39 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0255  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  25 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  30.6 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  24.11 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  24.91 
 
 		 281 aa  67  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2240  aminotransferase class IV  29.7 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  27.95 
 
 		 276 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  26.42 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  21.83 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  23.48 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>