More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2604 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2604  aminotransferase class IV  100 
 
 		 270 aa  540  1e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.946338  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2240  aminotransferase class IV  78.15 
 
 		 270 aa  436  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29691  aminotransferases class-IV  56.04 
 
 		 286 aa  298  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1295  aminotransferase class-IV  48.5 
 
 		 275 aa  285  4e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.326181  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21671  aminotransferases class-IV  48.5 
 
 		 275 aa  284  9e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.221172 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18261  aminotransferase class-IV  44.69 
 
 		 276 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18841  aminotransferases class-IV  35.64 
 
 		 275 aa  198  7e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18841  aminotransferases class-IV  34.43 
 
 		 275 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1786  aminotransferase class-IV  34.8 
 
 		 275 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.285091  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19031  aminotransferases class-IV  34.43 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35016  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  37.12 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2898  aminotransferase, class IV  37.21 
 
 		 270 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.051905 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  37.55 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.6 
 
 		 288 aa  116  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  33.94 
 
 		 282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  31.93 
 
 		 263 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  33.33 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  31.56 
 
 		 266 aa  99.8  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  32.38 
 
 		 277 aa  99  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  27.17 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  33.74 
 
 		 280 aa  97.4  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  35.89 
 
 		 287 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  27.2 
 
 		 276 aa  95.9  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  32.49 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  33.46 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  30.4 
 
 		 276 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  31.78 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  30.04 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  33.06 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  30.14 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  30.57 
 
 		 282 aa  92.8  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1139  aminotransferase class IV  34.94 
 
 		 288 aa  92.8  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.092565  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  34.88 
 
 		 296 aa  92.4  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  27.7 
 
 		 287 aa  92.4  7e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  28.17 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  27.7 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4377  aminotransferase class IV  32.38 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.505275  normal  0.583274 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.11 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  26.09 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  25.19 
 
 		 297 aa  89  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  25.17 
 
 		 292 aa  89  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  26.76 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  27.03 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  27.03 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  27.03 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  27.03 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  27.03 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  27.03 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  27.03 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  34.92 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  31.34 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  27.03 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  27.03 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  29.27 
 
 		 281 aa  85.5  8e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  29.27 
 
 		 287 aa  85.5  8e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  30.37 
 
 		 283 aa  85.5  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  30.96 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  31.19 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  24.83 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  26.58 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  26.99 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  27.23 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  30.15 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0953  aminotransferase class IV  31.92 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  24.13 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  28.3 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  26.55 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  26.55 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  26.55 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  26.55 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  26.55 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  26.55 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  26.55 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  26.55 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1095  branched-chain amino acid aminotransferase, putative  26.18 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0167966  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  26.11 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  28.2 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  26.55 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  26.24 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  26.44 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  26.99 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0141  aminotransferase, class IV  26.91 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  26.64 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  27.92 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  26.61 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  29.25 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  31.67 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  29.86 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  25.68 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  23.61 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  24.1 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  23.01 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  30.25 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  27.04 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  25.45 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1273  putative branched-chain amino acid aminotransferase  26.18 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  26.69 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  25.28 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0051  aminotransferase class IV  34.82 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4200  aminotransferase class IV  35.8 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.108763  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>