More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0651 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0651  para-aminobenzoate synthase, subunit I  100 
 
 		 629 aa  1241    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3062  para-aminobenzoate synthase, subunit I  56.22 
 
 		 630 aa  640    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  57.32 
 
 		 623 aa  625  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2495  para-aminobenzoate synthase, subunit I  52.19 
 
 		 621 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0739  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.62 
 
 		 638 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2631  para-aminobenzoate synthase, subunit I  53.63 
 
 		 620 aa  567  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3959  Para-aminobenzoate synthase, component I  52.54 
 
 		 640 aa  565  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3841  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  51.21 
 
 		 644 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0723  chorismate binding-like protein  51.31 
 
 		 635 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2844  para-aminobenzoate synthase, subunit I  54.71 
 
 		 673 aa  548  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0929877  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0671  chorismate binding-like protein  51.45 
 
 		 648 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0754  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.84 
 
 		 637 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0270  para-aminobenzoate synthase, component I  50.69 
 
 		 637 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1310  chorismate binding enzyme  49.85 
 
 		 669 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255509  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2324  chorismate binding enzyme  50.3 
 
 		 668 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3318  chorismate binding enzyme  50.3 
 
 		 668 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0503  chorismate binding enzyme  50.3 
 
 		 668 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3275  para-aminobenzoate synthase, component I  50.3 
 
 		 668 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.964466  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3308  para-aminobenzoate synthase, component I  49.93 
 
 		 669 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2203  para-aminobenzoate synthase, component I  50.3 
 
 		 668 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0648  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  51.22 
 
 		 639 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1096  chorismate binding enzyme  50.3 
 
 		 668 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.47 
 
 		 632 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2868  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.47 
 
 		 632 aa  525  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2633  putative PARA-aminobenzoate synthetase component I protein  51.66 
 
 		 626 aa  510  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2783  Para-aminobenzoate synthase, component I  49.67 
 
 		 595 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.688281  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2920  para-aminobenzoate synthase, component I  46.78 
 
 		 637 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0745  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  38.82 
 
 		 607 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.766935  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.44 
 
 		 629 aa  368  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2989  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.06 
 
 		 584 aa  351  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.57 
 
 		 601 aa  345  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0163  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.76 
 
 		 587 aa  333  5e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3087  Para-aminobenzoate synthase, component I  45.26 
 
 		 555 aa  332  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972054  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0171  para-aminobenzoate synthase, component I  41.07 
 
 		 612 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0332  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.05 
 
 		 573 aa  320  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42564e-18 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.07 
 
 		 618 aa  309  1.0000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3849  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.63 
 
 		 599 aa  306  8.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.5 
 
 		 607 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0607  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.76 
 
 		 574 aa  301  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.37 
 
 		 611 aa  295  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3010  Para-aminobenzoate synthase, component I  37.29 
 
 		 586 aa  294  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.173618  normal  0.824102 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  40.7 
 
 		 596 aa  293  5e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0904  para-aminobenzoate synthase, component I  40.78 
 
 		 594 aa  293  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0422  Para-aminobenzoate synthase, component I  39.72 
 
 		 590 aa  291  3e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.744844  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0939  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.31 
 
 		 591 aa  290  8e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0809  para-aminobenzoate synthetase component I  35.71 
 
 		 572 aa  289  1e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1528  chorismate binding enzyme  36.06 
 
 		 571 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0770675  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0445  para-aminobenzoate synthase, component I  38.7 
 
 		 595 aa  283  5.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2871  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.98 
 
 		 617 aa  283  9e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872704  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2835  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.18 
 
 		 599 aa  282  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1629  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.36 
 
 		 553 aa  281  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.810406  normal  0.772192 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.8 
 
 		 592 aa  276  6e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3314  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  38.98 
 
 		 615 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1011  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  29.67 
 
 		 594 aa  273  8.000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00630898  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0949  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  29.22 
 
 		 594 aa  272  2e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.969894  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0380  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.76 
 
 		 577 aa  271  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0364924  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1683  Para-aminobenzoate synthase, component I  39.21 
 
 		 615 aa  271  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.67 
 
 		 615 aa  271  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0878  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  28.73 
 
 		 594 aa  267  4e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0178377  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3496  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.85 
 
 		 599 aa  267  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466989  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0984  para-aminobenzoate synthase component I, ADC synthase  30.76 
 
 		 582 aa  255  2.0000000000000002e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31460  aminodeoxychorismate synthase, component I  41.7 
 
 		 587 aa  254  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.03 
 
 		 710 aa  253  9.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2819  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.67 
 
 		 599 aa  249  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1357  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.72 
 
 		 635 aa  246  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963322  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4435  aminodeoxychorismate synthase  49.66 
 
 		 388 aa  226  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.980894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2685  aminodeoxychorismate synthase  47.67 
 
 		 385 aa  220  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.627045 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0817  aminodeoxychorismate synthase  51.65 
 
 		 390 aa  219  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.244151  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2474  aminodeoxychorismate synthase  51.28 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0075  aminodeoxychorismate synthase  46.93 
 
 		 389 aa  218  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.93 
 
 		 741 aa  216  7e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0633  aminodeoxychorismate synthase  41.49 
 
 		 398 aa  216  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0362  aminodeoxychorismate synthase  50.92 
 
 		 390 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.969651 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3297  aminodeoxychorismate synthase  45.07 
 
 		 386 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2729  aminodeoxychorismate synthase  45.64 
 
 		 385 aa  213  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0754  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  34.99 
 
 		 383 aa  213  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0738  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  34.99 
 
 		 383 aa  213  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3598  aminodeoxychorismate synthase  44.72 
 
 		 384 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3703  aminodeoxychorismate synthase  44.91 
 
 		 411 aa  210  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0080  aminodeoxychorismate synthase  46.21 
 
 		 389 aa  210  7e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4261  aminodeoxychorismate synthase  46.32 
 
 		 386 aa  210  8e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0427  para-aminobenzoate synthase component I  34.99 
 
 		 586 aa  209  9e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.71 
 
 		 466 aa  206  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2897  para-aminobenzoate synthase, component I  46.74 
 
 		 686 aa  203  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0159595  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.51 
 
 		 480 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  43.39 
 
 		 447 aa  200  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  44.98 
 
 		 453 aa  200  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.17 
 
 		 480 aa  200  7.999999999999999e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.88 
 
 		 721 aa  199  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  47.17 
 
 		 462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.64 
 
 		 490 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  44.44 
 
 		 468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.96 
 
 		 470 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.96 
 
 		 470 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.23 
 
 		 447 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.59 
 
 		 470 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4527  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  43.6 
 
 		 437 aa  196  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  42.38 
 
 		 471 aa  195  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  40.75 
 
 		 454 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  41.44 
 
 		 454 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>