More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3959 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2495  para-aminobenzoate synthase, subunit I  67.29 
 
 		 621 aa  852    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0671  chorismate binding-like protein  63.76 
 
 		 648 aa  797    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117508  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2324  chorismate binding enzyme  63.77 
 
 		 668 aa  789    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0503  chorismate binding enzyme  63.77 
 
 		 668 aa  789    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710623  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  57.52 
 
 		 623 aa  652    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3318  chorismate binding enzyme  63.77 
 
 		 668 aa  789    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3841  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  63.58 
 
 		 644 aa  793    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2631  para-aminobenzoate synthase, subunit I  63.82 
 
 		 620 aa  790    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0723  chorismate binding-like protein  64.81 
 
 		 635 aa  793    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1310  chorismate binding enzyme  62.71 
 
 		 669 aa  787    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255509  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3275  para-aminobenzoate synthase, component I  64.07 
 
 		 668 aa  788    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.964466  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3959  Para-aminobenzoate synthase, component I  100 
 
 		 640 aa  1306    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3308  para-aminobenzoate synthase, component I  63.08 
 
 		 669 aa  782    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0270  para-aminobenzoate synthase, component I  64.24 
 
 		 637 aa  785    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0739  para-aminobenzoate synthase, subunit I  84.98 
 
 		 638 aa  1077    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2203  para-aminobenzoate synthase, component I  63.77 
 
 		 668 aa  789    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0648  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  64.17 
 
 		 639 aa  780    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1096  chorismate binding enzyme  63.77 
 
 		 668 aa  789    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0754  para-aminobenzoate synthase, subunit I  64.24 
 
 		 637 aa  784    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3062  para-aminobenzoate synthase, subunit I  55.78 
 
 		 630 aa  630  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.7 
 
 		 632 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2844  para-aminobenzoate synthase, subunit I  54.37 
 
 		 673 aa  570  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0929877  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2633  putative PARA-aminobenzoate synthetase component I protein  52.78 
 
 		 626 aa  566  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2868  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.84 
 
 		 632 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0651  para-aminobenzoate synthase, subunit I  52.54 
 
 		 629 aa  561  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2920  para-aminobenzoate synthase, component I  50.55 
 
 		 637 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2783  Para-aminobenzoate synthase, component I  50.81 
 
 		 595 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.688281  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0745  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  39.97 
 
 		 607 aa  427  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.766935  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  38.01 
 
 		 629 aa  388  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3087  Para-aminobenzoate synthase, component I  44.79 
 
 		 555 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972054  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.92 
 
 		 601 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0163  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.95 
 
 		 587 aa  351  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.15 
 
 		 618 aa  347  4e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0332  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.36 
 
 		 573 aa  343  8e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42564e-18 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0171  para-aminobenzoate synthase, component I  38.45 
 
 		 612 aa  341  2e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.7 
 
 		 607 aa  326  8.000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0607  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.5 
 
 		 574 aa  324  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2989  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.75 
 
 		 584 aa  322  9.999999999999999e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0445  para-aminobenzoate synthase, component I  39.06 
 
 		 595 aa  322  9.999999999999999e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3010  Para-aminobenzoate synthase, component I  37.16 
 
 		 586 aa  319  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.173618  normal  0.824102 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  37.01 
 
 		 596 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0422  Para-aminobenzoate synthase, component I  41.4 
 
 		 590 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.744844  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2871  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.4 
 
 		 617 aa  307  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872704  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3849  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.08 
 
 		 599 aa  303  7.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2835  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.87 
 
 		 599 aa  302  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0380  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.04 
 
 		 577 aa  298  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0364924  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.57 
 
 		 615 aa  295  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.77 
 
 		 611 aa  293  6e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0939  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.8 
 
 		 591 aa  291  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1629  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.75 
 
 		 553 aa  289  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.810406  normal  0.772192 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1683  Para-aminobenzoate synthase, component I  37.33 
 
 		 615 aa  288  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3496  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.22 
 
 		 599 aa  286  7e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466989  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0904  para-aminobenzoate synthase, component I  41.54 
 
 		 594 aa  286  8e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0809  para-aminobenzoate synthetase component I  34.18 
 
 		 572 aa  283  7.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3314  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  40.38 
 
 		 615 aa  282  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.99 
 
 		 592 aa  281  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1528  chorismate binding enzyme  34.69 
 
 		 571 aa  278  2e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0770675  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1011  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  29.86 
 
 		 594 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00630898  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2819  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.14 
 
 		 599 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0949  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  29.86 
 
 		 594 aa  268  2e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.969894  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0878  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  29.7 
 
 		 594 aa  268  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0178377  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1357  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.92 
 
 		 635 aa  261  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963322  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.89 
 
 		 710 aa  257  4e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0427  para-aminobenzoate synthase component I  36.11 
 
 		 586 aa  246  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31460  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.65 
 
 		 587 aa  245  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0984  para-aminobenzoate synthase component I, ADC synthase  30.58 
 
 		 582 aa  244  5e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0817  aminodeoxychorismate synthase  47.57 
 
 		 390 aa  231  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.244151  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2474  aminodeoxychorismate synthase  47.25 
 
 		 381 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4435  aminodeoxychorismate synthase  45.61 
 
 		 388 aa  222  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.980894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0362  aminodeoxychorismate synthase  47.46 
 
 		 390 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.969651 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0633  aminodeoxychorismate synthase  44.59 
 
 		 398 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2729  aminodeoxychorismate synthase  48.03 
 
 		 385 aa  217  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0075  aminodeoxychorismate synthase  44.33 
 
 		 389 aa  213  9e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4261  aminodeoxychorismate synthase  44.09 
 
 		 386 aa  211  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0754  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  34.76 
 
 		 383 aa  210  8e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0738  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  34.76 
 
 		 383 aa  210  8e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0080  aminodeoxychorismate synthase  43.62 
 
 		 389 aa  209  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  31.31 
 
 		 741 aa  208  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  43 
 
 		 462 aa  207  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43 
 
 		 480 aa  207  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2685  aminodeoxychorismate synthase  44.52 
 
 		 385 aa  206  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.627045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3297  aminodeoxychorismate synthase  43.88 
 
 		 386 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3598  aminodeoxychorismate synthase  43.15 
 
 		 384 aa  203  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.59 
 
 		 480 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  38.38 
 
 		 447 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3703  aminodeoxychorismate synthase  41.78 
 
 		 411 aa  199  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  42.53 
 
 		 468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.86 
 
 		 509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.36 
 
 		 450 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.2 
 
 		 470 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  38.61 
 
 		 466 aa  196  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  40.94 
 
 		 471 aa  196  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  37.93 
 
 		 453 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  41.98 
 
 		 447 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2897  para-aminobenzoate synthase, component I  39.5 
 
 		 686 aa  196  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0159595  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  38.05 
 
 		 408 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.78 
 
 		 470 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.43 
 
 		 466 aa  194  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.78 
 
 		 470 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.78 
 
 		 470 aa  194  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>