More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2685 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2685  aminodeoxychorismate synthase  100 
 
 		 385 aa  786    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.627045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3598  aminodeoxychorismate synthase  75.59 
 
 		 384 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3297  aminodeoxychorismate synthase  74.35 
 
 		 386 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3703  aminodeoxychorismate synthase  59.55 
 
 		 411 aa  481  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0075  aminodeoxychorismate synthase  60.79 
 
 		 389 aa  478  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0080  aminodeoxychorismate synthase  60.26 
 
 		 389 aa  471  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4261  aminodeoxychorismate synthase  59.95 
 
 		 386 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2729  aminodeoxychorismate synthase  60.48 
 
 		 385 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0633  aminodeoxychorismate synthase  50.27 
 
 		 398 aa  331  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0362  aminodeoxychorismate synthase  48.65 
 
 		 390 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.969651 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0817  aminodeoxychorismate synthase  52.28 
 
 		 390 aa  316  5e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.244151  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2474  aminodeoxychorismate synthase  52.28 
 
 		 381 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4435  aminodeoxychorismate synthase  48.48 
 
 		 388 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.980894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.6 
 
 		 601 aa  297  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0163  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.11 
 
 		 587 aa  280  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.51 
 
 		 615 aa  269  7e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.9 
 
 		 629 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.38 
 
 		 607 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.8 
 
 		 710 aa  260  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.62 
 
 		 618 aa  257  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0809  para-aminobenzoate synthetase component I  37.85 
 
 		 572 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0445  para-aminobenzoate synthase, component I  40.1 
 
 		 595 aa  253  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.35 
 
 		 611 aa  251  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  41.84 
 
 		 596 aa  249  8e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31460  aminodeoxychorismate synthase, component I  41.44 
 
 		 587 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.43 
 
 		 592 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0422  Para-aminobenzoate synthase, component I  40.82 
 
 		 590 aa  243  6e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.744844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0607  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.98 
 
 		 574 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2989  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.62 
 
 		 584 aa  239  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3010  Para-aminobenzoate synthase, component I  41.85 
 
 		 586 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.173618  normal  0.824102 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3087  Para-aminobenzoate synthase, component I  43.62 
 
 		 555 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972054  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3849  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.85 
 
 		 599 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3314  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  40.74 
 
 		 615 aa  233  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0171  para-aminobenzoate synthase, component I  41.27 
 
 		 612 aa  232  8.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0380  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.81 
 
 		 577 aa  230  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0364924  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3062  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.79 
 
 		 630 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0332  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.88 
 
 		 573 aa  229  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42564e-18 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1629  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.39 
 
 		 553 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.810406  normal  0.772192 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2819  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.01 
 
 		 599 aa  226  8e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1528  chorismate binding enzyme  34.75 
 
 		 571 aa  224  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0770675  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3496  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.74 
 
 		 599 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466989  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2871  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.18 
 
 		 617 aa  224  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872704  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.83 
 
 		 447 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3468  anthranilate synthase, component II  42.75 
 
 		 714 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.841955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  39.3 
 
 		 458 aa  220  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.15 
 
 		 732 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00431194  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2835  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.77 
 
 		 599 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0939  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.32 
 
 		 591 aa  219  7.999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0310  para-aminobenzoate synthase subunit I  44.4 
 
 		 731 aa  219  8.999999999999998e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.764542  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1376  aminodeoxychorismate synthase  36.69 
 
 		 453 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.661176  normal  0.079748 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2541  aminodeoxychorismate synthase  37.14 
 
 		 453 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.169515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1902  para-aminobenzoate synthase component I  36.95 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1580  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38 
 
 		 449 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00938463  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01914  para-aminobenzoate synthase, component I  39.05 
 
 		 456 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1831  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.69 
 
 		 453 aa  216  7e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1821  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.69 
 
 		 453 aa  216  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1913  para-aminobenzoate synthase, component I  44.7 
 
 		 509 aa  216  8e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199301  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01782  para-aminobenzoate synthase component I  36.69 
 
 		 453 aa  215  9e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2040  para-aminobenzoate synthase component I  36.69 
 
 		 453 aa  215  9e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01770  hypothetical protein  36.69 
 
 		 445 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.994837  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2073  aminodeoxychorismate synthase  36.88 
 
 		 453 aa  215  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3614  para-aminobenzoate synthase component I  34.71 
 
 		 497 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.46 
 
 		 490 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  43.89 
 
 		 408 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1683  Para-aminobenzoate synthase, component I  38.93 
 
 		 615 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2226  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.8 
 
 		 467 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  hitchhiker  0.0081347 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2633  putative PARA-aminobenzoate synthetase component I protein  48.57 
 
 		 626 aa  212  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2631  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.19 
 
 		 620 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.64 
 
 		 446 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2868  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45 
 
 		 632 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.17 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2495  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.04 
 
 		 621 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.87 
 
 		 509 aa  210  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  39.26 
 
 		 447 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  42.48 
 
 		 623 aa  209  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.43 
 
 		 632 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  38.3 
 
 		 453 aa  209  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.75 
 
 		 446 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.79 
 
 		 450 aa  209  6e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  43.87 
 
 		 471 aa  208  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1978  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.85 
 
 		 474 aa  208  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.306568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0739  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.25 
 
 		 638 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.75 
 
 		 447 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  0.0000000000236319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.36 
 
 		 447 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  38.04 
 
 		 460 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2157  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.19 
 
 		 473 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169831  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.87 
 
 		 466 aa  207  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  44.71 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.97 
 
 		 470 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3959  Para-aminobenzoate synthase, component I  44.52 
 
 		 640 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.27 
 
 		 467 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.6 
 
 		 470 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.94 
 
 		 466 aa  206  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0904  para-aminobenzoate synthase, component I  45.52 
 
 		 594 aa  206  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.24 
 
 		 470 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1627  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.08 
 
 		 458 aa  206  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.18817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.75 
 
 		 721 aa  206  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0651  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.67 
 
 		 629 aa  205  9e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  44.49 
 
 		 471 aa  205  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.83 
 
 		 480 aa  205  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>