More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0490 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  54.71 
 
 
618 aa  637    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  100 
 
 
607 aa  1247    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.15 
 
 
615 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.08 
 
 
611 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.42 
 
 
710 aa  543  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0422  Para-aminobenzoate synthase, component I  46.67 
 
 
590 aa  528  1e-149  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.744844  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1683  Para-aminobenzoate synthase, component I  47.48 
 
 
615 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.85 
 
 
601 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  38.73 
 
 
629 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0163  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.58 
 
 
587 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.88 
 
 
592 aa  381  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0380  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.77 
 
 
577 aa  376  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0364924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0332  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.8 
 
 
573 aa  364  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42564e-18 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3010  Para-aminobenzoate synthase, component I  38.57 
 
 
586 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.173618  normal  0.824102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2989  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.04 
 
 
584 aa  351  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0607  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.92 
 
 
574 aa  343  8e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  36.33 
 
 
596 aa  342  9e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2495  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.28 
 
 
621 aa  342  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0739  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.35 
 
 
638 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647067  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0723  chorismate binding-like protein  39.92 
 
 
635 aa  336  9e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0171  para-aminobenzoate synthase, component I  35.97 
 
 
612 aa  335  1e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1629  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.29 
 
 
553 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.810406  normal  0.772192 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2868  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.02 
 
 
632 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1528  chorismate binding enzyme  33.98 
 
 
571 aa  330  5.0000000000000004e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0770675  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.82 
 
 
632 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2631  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.2 
 
 
620 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0809  para-aminobenzoate synthetase component I  34.39 
 
 
572 aa  327  4.0000000000000003e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0270  para-aminobenzoate synthase, component I  38.88 
 
 
637 aa  327  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0754  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.68 
 
 
637 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0671  chorismate binding-like protein  37.19 
 
 
648 aa  324  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117508  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3087  Para-aminobenzoate synthase, component I  40.11 
 
 
555 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972054  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3841  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  39.92 
 
 
644 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2633  putative PARA-aminobenzoate synthetase component I protein  39.89 
 
 
626 aa  321  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10225  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2871  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.18 
 
 
617 aa  315  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872704  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0445  para-aminobenzoate synthase, component I  36.72 
 
 
595 aa  315  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31460  aminodeoxychorismate synthase, component I  36.41 
 
 
587 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0904  para-aminobenzoate synthase, component I  39.65 
 
 
594 aa  313  6.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3959  Para-aminobenzoate synthase, component I  40.7 
 
 
640 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0648  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  37.46 
 
 
639 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1357  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.35 
 
 
635 aa  310  5.9999999999999995e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963322  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1310  chorismate binding enzyme  36.92 
 
 
669 aa  309  9e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255509  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3849  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.49 
 
 
599 aa  303  9e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  37.19 
 
 
623 aa  301  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2920  para-aminobenzoate synthase, component I  37.2 
 
 
637 aa  301  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388176  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0878  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  30.79 
 
 
594 aa  300  4e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0178377  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1011  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  30.79 
 
 
594 aa  300  6e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00630898  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0745  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  37.94 
 
 
607 aa  300  7e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.766935  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0984  para-aminobenzoate synthase component I, ADC synthase  32.06 
 
 
582 aa  299  9e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3062  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.17 
 
 
630 aa  298  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3275  para-aminobenzoate synthase, component I  36.42 
 
 
668 aa  297  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.964466  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0949  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  31.4 
 
 
594 aa  297  4e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.969894  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2324  chorismate binding enzyme  36.42 
 
 
668 aa  297  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1096  chorismate binding enzyme  36.42 
 
 
668 aa  297  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3318  chorismate binding enzyme  36.42 
 
 
668 aa  297  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2203  para-aminobenzoate synthase, component I  36.42 
 
 
668 aa  297  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0503  chorismate binding enzyme  36.42 
 
 
668 aa  297  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710623  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3314  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  38.73 
 
 
615 aa  296  9e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2783  Para-aminobenzoate synthase, component I  36.66 
 
 
595 aa  293  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.688281  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2819  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.65 
 
 
599 aa  293  5e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3496  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.31 
 
 
599 aa  293  5e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466989  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2835  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.86 
 
 
599 aa  293  5e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0651  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.52 
 
 
629 aa  289  8e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2844  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.24 
 
 
673 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0929877  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4261  aminodeoxychorismate synthase  42.39 
 
 
386 aa  278  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0427  para-aminobenzoate synthase component I  34.2 
 
 
586 aa  277  4e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2729  aminodeoxychorismate synthase  44.29 
 
 
385 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0075  aminodeoxychorismate synthase  42.12 
 
 
389 aa  273  7e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0633  aminodeoxychorismate synthase  44.08 
 
 
398 aa  273  7e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3703  aminodeoxychorismate synthase  40.53 
 
 
411 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0939  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.02 
 
 
591 aa  267  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0080  aminodeoxychorismate synthase  41.58 
 
 
389 aa  266  7e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4435  aminodeoxychorismate synthase  43.67 
 
 
388 aa  266  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.980894  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3598  aminodeoxychorismate synthase  41.64 
 
 
384 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3297  aminodeoxychorismate synthase  41.64 
 
 
386 aa  264  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0817  aminodeoxychorismate synthase  46.59 
 
 
390 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.244151  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2685  aminodeoxychorismate synthase  41.38 
 
 
385 aa  263  8.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.627045 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2474  aminodeoxychorismate synthase  46.32 
 
 
381 aa  260  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0362  aminodeoxychorismate synthase  44.38 
 
 
390 aa  257  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.969651 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0615  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.44 
 
 
434 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0184347  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.33 
 
 
741 aa  240  6.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  38.48 
 
 
430 aa  234  4.0000000000000004e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.04 
 
 
482 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151682  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1978  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.74 
 
 
474 aa  233  7.000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.306568  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3888  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  45.28 
 
 
480 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.353677  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1913  para-aminobenzoate synthase, component I  41.55 
 
 
509 aa  231  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199301  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  44.66 
 
 
430 aa  230  4e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  45.39 
 
 
480 aa  230  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  46.97 
 
 
468 aa  230  6e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  45.49 
 
 
408 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.41 
 
 
452 aa  228  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.52 
 
 
509 aa  227  5.0000000000000005e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3994  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.04 
 
 
493 aa  226  8e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.906481  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2217  Anthranilate synthase  34.06 
 
 
439 aa  226  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.58 
 
 
490 aa  225  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3468  anthranilate synthase, component II  41.3 
 
 
714 aa  224  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.841955  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0754  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  44.02 
 
 
383 aa  224  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C07  anthranilate/para-aminobenzoate synthase component I  30.43 
 
 
641 aa  224  4e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0738  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  44.02 
 
 
383 aa  224  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  43.98 
 
 
453 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  40.89 
 
 
453 aa  223  9e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>