More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1992 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  100 
 
 
611 aa  1252    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  55.24 
 
 
615 aa  640    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.68 
 
 
710 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.08 
 
 
607 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.17 
 
 
618 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1683  Para-aminobenzoate synthase, component I  51.33 
 
 
615 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0422  Para-aminobenzoate synthase, component I  48.12 
 
 
590 aa  524  1e-147  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.744844  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.28 
 
 
601 aa  486  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.76 
 
 
629 aa  378  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0380  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.77 
 
 
577 aa  365  1e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0364924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0332  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.01 
 
 
573 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42564e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0163  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.09 
 
 
587 aa  362  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3010  Para-aminobenzoate synthase, component I  41.91 
 
 
586 aa  360  5e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.173618  normal  0.824102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0607  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.17 
 
 
574 aa  359  7e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2989  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.08 
 
 
584 aa  359  8e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.21 
 
 
592 aa  352  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  38.44 
 
 
596 aa  333  6e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3087  Para-aminobenzoate synthase, component I  42.08 
 
 
555 aa  332  9e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972054  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0809  para-aminobenzoate synthetase component I  34.68 
 
 
572 aa  332  1e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0171  para-aminobenzoate synthase, component I  37.61 
 
 
612 aa  329  8e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1629  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.63 
 
 
553 aa  327  5e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.810406  normal  0.772192 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1528  chorismate binding enzyme  32.38 
 
 
571 aa  317  5e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0770675  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1357  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.24 
 
 
635 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963322  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3496  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.44 
 
 
599 aa  313  6.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466989  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3314  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  37.96 
 
 
615 aa  309  9e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2495  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.57 
 
 
621 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2819  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.93 
 
 
599 aa  306  6e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3849  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.82 
 
 
599 aa  301  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3062  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.69 
 
 
630 aa  301  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2835  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.44 
 
 
599 aa  301  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2871  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.67 
 
 
617 aa  301  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872704  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3275  para-aminobenzoate synthase, component I  36.19 
 
 
668 aa  299  9e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.964466  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0745  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  35.75 
 
 
607 aa  299  9e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.766935  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2324  chorismate binding enzyme  36.19 
 
 
668 aa  299  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2203  para-aminobenzoate synthase, component I  36.19 
 
 
668 aa  299  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1096  chorismate binding enzyme  36.19 
 
 
668 aa  299  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3318  chorismate binding enzyme  36.19 
 
 
668 aa  299  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0503  chorismate binding enzyme  36.19 
 
 
668 aa  299  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710623  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2631  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.77 
 
 
620 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0878  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  33.84 
 
 
594 aa  298  2e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0178377  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0949  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  35.97 
 
 
594 aa  296  5e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.969894  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0445  para-aminobenzoate synthase, component I  36.01 
 
 
595 aa  296  7e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.98 
 
 
632 aa  296  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0739  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.77 
 
 
638 aa  295  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647067  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1011  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  35.57 
 
 
594 aa  293  6e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00630898  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2633  putative PARA-aminobenzoate synthetase component I protein  37.78 
 
 
626 aa  291  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10225  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0723  chorismate binding-like protein  36.06 
 
 
635 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31460  aminodeoxychorismate synthase, component I  36.38 
 
 
587 aa  291  3e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2868  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.9 
 
 
632 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0904  para-aminobenzoate synthase, component I  39.05 
 
 
594 aa  289  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0427  para-aminobenzoate synthase component I  34.02 
 
 
586 aa  288  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3841  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  35.66 
 
 
644 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0270  para-aminobenzoate synthase, component I  35.78 
 
 
637 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0754  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.54 
 
 
637 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3308  para-aminobenzoate synthase, component I  35.77 
 
 
669 aa  283  9e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0671  chorismate binding-like protein  34.81 
 
 
648 aa  283  9e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117508  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0939  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.38 
 
 
591 aa  282  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0984  para-aminobenzoate synthase component I, ADC synthase  33.5 
 
 
582 aa  280  7e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3959  Para-aminobenzoate synthase, component I  37.77 
 
 
640 aa  277  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  36.26 
 
 
623 aa  276  8e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2783  Para-aminobenzoate synthase, component I  38.02 
 
 
595 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.688281  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0651  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.37 
 
 
629 aa  274  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0648  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  35.33 
 
 
639 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2729  aminodeoxychorismate synthase  43.67 
 
 
385 aa  272  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3703  aminodeoxychorismate synthase  41.34 
 
 
411 aa  261  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4261  aminodeoxychorismate synthase  41.92 
 
 
386 aa  260  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0075  aminodeoxychorismate synthase  40.97 
 
 
389 aa  258  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2474  aminodeoxychorismate synthase  44.47 
 
 
381 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0817  aminodeoxychorismate synthase  44.2 
 
 
390 aa  253  6e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.244151  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0080  aminodeoxychorismate synthase  40.7 
 
 
389 aa  252  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0633  aminodeoxychorismate synthase  43.37 
 
 
398 aa  252  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2685  aminodeoxychorismate synthase  42.35 
 
 
385 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.627045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3297  aminodeoxychorismate synthase  40.22 
 
 
386 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3598  aminodeoxychorismate synthase  39.94 
 
 
384 aa  249  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  46.72 
 
 
408 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0362  aminodeoxychorismate synthase  42.67 
 
 
390 aa  247  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.969651 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4435  aminodeoxychorismate synthase  42.16 
 
 
388 aa  246  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.980894  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2844  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.08 
 
 
673 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0929877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  45.26 
 
 
453 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2920  para-aminobenzoate synthase, component I  35.7 
 
 
637 aa  240  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388176  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3888  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  47.53 
 
 
480 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.353677  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0615  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.2 
 
 
434 aa  239  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0184347  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.53 
 
 
482 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151682  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  49.41 
 
 
468 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.7 
 
 
469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2217  Anthranilate synthase  35.25 
 
 
439 aa  229  9e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3444  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.67 
 
 
435 aa  229  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.716101  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.45 
 
 
721 aa  228  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3994  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.77 
 
 
493 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.906481  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0310  para-aminobenzoate synthase subunit I  43.69 
 
 
731 aa  225  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.764542  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.68 
 
 
447 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  30.12 
 
 
741 aa  224  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.32 
 
 
509 aa  222  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.49 
 
 
466 aa  221  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  41.31 
 
 
453 aa  221  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  40.07 
 
 
430 aa  219  7.999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  42.59 
 
 
471 aa  219  8.999999999999998e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  40.07 
 
 
430 aa  219  8.999999999999998e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  41.98 
 
 
447 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  42.7 
 
 
495 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>