More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0171 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0171  para-aminobenzoate synthase, component I  100 
 
 
612 aa  1202    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0445  para-aminobenzoate synthase, component I  50.25 
 
 
595 aa  503  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0607  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.48 
 
 
574 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.33 
 
 
592 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.07 
 
 
629 aa  381  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.72 
 
 
601 aa  379  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3087  Para-aminobenzoate synthase, component I  45.45 
 
 
555 aa  369  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972054  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0163  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.02 
 
 
587 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  39.87 
 
 
596 aa  359  7e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3010  Para-aminobenzoate synthase, component I  40.31 
 
 
586 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.173618  normal  0.824102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0380  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.65 
 
 
577 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0364924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0332  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.37 
 
 
573 aa  355  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42564e-18 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2868  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.64 
 
 
632 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.8 
 
 
632 aa  353  5e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2871  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.93 
 
 
617 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872704  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0739  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.12 
 
 
638 aa  350  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647067  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2495  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.17 
 
 
621 aa  350  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1629  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.15 
 
 
553 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.810406  normal  0.772192 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.38 
 
 
618 aa  346  6e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0422  Para-aminobenzoate synthase, component I  37.9 
 
 
590 aa  346  7e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.744844  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1310  chorismate binding enzyme  39.84 
 
 
669 aa  345  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255509  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.97 
 
 
607 aa  343  4e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  39.87 
 
 
623 aa  342  1e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0723  chorismate binding-like protein  39.63 
 
 
635 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2631  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.52 
 
 
620 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.61 
 
 
611 aa  341  2.9999999999999998e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2324  chorismate binding enzyme  39.34 
 
 
668 aa  339  7e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1096  chorismate binding enzyme  39.34 
 
 
668 aa  339  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3318  chorismate binding enzyme  39.34 
 
 
668 aa  339  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2203  para-aminobenzoate synthase, component I  39.34 
 
 
668 aa  339  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0503  chorismate binding enzyme  39.34 
 
 
668 aa  339  7e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710623  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3959  Para-aminobenzoate synthase, component I  38.45 
 
 
640 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3275  para-aminobenzoate synthase, component I  39.34 
 
 
668 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.964466  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3062  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.08 
 
 
630 aa  337  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2633  putative PARA-aminobenzoate synthetase component I protein  41.57 
 
 
626 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10225  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0754  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.69 
 
 
637 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3308  para-aminobenzoate synthase, component I  39.14 
 
 
669 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2989  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.68 
 
 
584 aa  335  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0671  chorismate binding-like protein  38.47 
 
 
648 aa  335  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117508  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0270  para-aminobenzoate synthase, component I  39.69 
 
 
637 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3841  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  39.57 
 
 
644 aa  331  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0745  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  34.62 
 
 
607 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.766935  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3849  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.17 
 
 
599 aa  327  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0648  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  39.41 
 
 
639 aa  324  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0651  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.07 
 
 
629 aa  319  7.999999999999999e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2835  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.04 
 
 
599 aa  316  6e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.9 
 
 
615 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2920  para-aminobenzoate synthase, component I  39.17 
 
 
637 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388176  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2844  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.92 
 
 
673 aa  299  8e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0929877  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0939  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.2 
 
 
591 aa  299  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1683  Para-aminobenzoate synthase, component I  36.03 
 
 
615 aa  298  3e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1528  chorismate binding enzyme  32.53 
 
 
571 aa  297  4e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0770675  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0904  para-aminobenzoate synthase, component I  41.01 
 
 
594 aa  289  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3496  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.03 
 
 
599 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466989  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3314  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  37.73 
 
 
615 aa  282  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0809  para-aminobenzoate synthetase component I  31.15 
 
 
572 aa  280  4e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2783  Para-aminobenzoate synthase, component I  39.82 
 
 
595 aa  277  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.688281  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2819  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.55 
 
 
599 aa  277  4e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1357  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.51 
 
 
635 aa  270  5.9999999999999995e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963322  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31460  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.03 
 
 
587 aa  269  8.999999999999999e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.69 
 
 
710 aa  264  3e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0427  para-aminobenzoate synthase component I  36.36 
 
 
586 aa  261  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3703  aminodeoxychorismate synthase  40.63 
 
 
411 aa  256  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.36 
 
 
470 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.55 
 
 
470 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3598  aminodeoxychorismate synthase  40.1 
 
 
384 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0362  aminodeoxychorismate synthase  46.63 
 
 
390 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.969651 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  49.64 
 
 
467 aa  244  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.37 
 
 
470 aa  244  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50 
 
 
470 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2685  aminodeoxychorismate synthase  41.27 
 
 
385 aa  243  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.627045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3297  aminodeoxychorismate synthase  39.45 
 
 
386 aa  242  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0075  aminodeoxychorismate synthase  40.15 
 
 
389 aa  241  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  49.25 
 
 
467 aa  240  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.55 
 
 
466 aa  240  5e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  50 
 
 
471 aa  239  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  49.43 
 
 
467 aa  238  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  47.78 
 
 
467 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2474  aminodeoxychorismate synthase  46.09 
 
 
381 aa  237  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0615  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.67 
 
 
434 aa  236  6e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0184347  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0817  aminodeoxychorismate synthase  46.09 
 
 
390 aa  236  7e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.244151  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4261  aminodeoxychorismate synthase  38.25 
 
 
386 aa  233  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1011  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  29.59 
 
 
594 aa  234  5e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00630898  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.32 
 
 
469 aa  233  9e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0633  aminodeoxychorismate synthase  43.44 
 
 
398 aa  233  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  47.48 
 
 
454 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0080  aminodeoxychorismate synthase  39.39 
 
 
389 aa  232  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  47.48 
 
 
454 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0878  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  29.98 
 
 
594 aa  231  4e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0178377  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0949  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  29.98 
 
 
594 aa  230  7e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.969894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  47.12 
 
 
454 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  47.12 
 
 
454 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1492  aminodeoxychorismate synthase subunit I  47.12 
 
 
454 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09868  para-aminobenzoate synthase, component I  40.44 
 
 
430 aa  228  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.83 
 
 
456 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1638  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.93 
 
 
457 aa  227  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3907  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.06 
 
 
472 aa  226  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177197  normal  0.165975 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.52 
 
 
452 aa  226  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4276  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.06 
 
 
466 aa  225  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.14 
 
 
480 aa  224  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>