More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2920 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2783  Para-aminobenzoate synthase, component I  71.38 
 
 		 595 aa  809    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.688281  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2920  para-aminobenzoate synthase, component I  100 
 
 		 637 aa  1273    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2868  para-aminobenzoate synthase, subunit I  52.97 
 
 		 632 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  53.3 
 
 		 632 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0739  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.32 
 
 		 638 aa  548  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  51.04 
 
 		 623 aa  542  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2633  putative PARA-aminobenzoate synthetase component I protein  52.55 
 
 		 626 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2631  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.42 
 
 		 620 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3959  Para-aminobenzoate synthase, component I  50.55 
 
 		 640 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2495  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.72 
 
 		 621 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3841  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  49.08 
 
 		 644 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0671  chorismate binding-like protein  48.54 
 
 		 648 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0723  chorismate binding-like protein  49.14 
 
 		 635 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1310  chorismate binding enzyme  47.38 
 
 		 669 aa  510  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255509  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0270  para-aminobenzoate synthase, component I  47.98 
 
 		 637 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0754  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.14 
 
 		 637 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0503  chorismate binding enzyme  47.98 
 
 		 668 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710623  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2324  chorismate binding enzyme  47.98 
 
 		 668 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1096  chorismate binding enzyme  47.98 
 
 		 668 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3318  chorismate binding enzyme  47.98 
 
 		 668 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3308  para-aminobenzoate synthase, component I  47.6 
 
 		 669 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2203  para-aminobenzoate synthase, component I  47.98 
 
 		 668 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3275  para-aminobenzoate synthase, component I  47.98 
 
 		 668 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.964466  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0648  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  49 
 
 		 639 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3062  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.26 
 
 		 630 aa  493  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0651  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.53 
 
 		 629 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2844  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.35 
 
 		 673 aa  416  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0929877  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0745  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  37.5 
 
 		 607 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.766935  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.42 
 
 		 601 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.22 
 
 		 629 aa  346  7e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3087  Para-aminobenzoate synthase, component I  41.9 
 
 		 555 aa  321  3e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972054  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3010  Para-aminobenzoate synthase, component I  39.48 
 
 		 586 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.173618  normal  0.824102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0607  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.74 
 
 		 574 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  38.42 
 
 		 596 aa  307  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.38 
 
 		 607 aa  306  6e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0163  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.54 
 
 		 587 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2989  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.64 
 
 		 584 aa  301  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0171  para-aminobenzoate synthase, component I  39.17 
 
 		 612 aa  301  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.38 
 
 		 618 aa  298  3e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3849  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.43 
 
 		 599 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0445  para-aminobenzoate synthase, component I  38.94 
 
 		 595 aa  290  7e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2835  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.37 
 
 		 599 aa  289  9e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0332  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.34 
 
 		 573 aa  289  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42564e-18 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0422  Para-aminobenzoate synthase, component I  37.41 
 
 		 590 aa  287  4e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.744844  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0380  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.43 
 
 		 577 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0364924  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0809  para-aminobenzoate synthetase component I  34.53 
 
 		 572 aa  283  8.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.1 
 
 		 592 aa  280  8e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2871  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.2 
 
 		 617 aa  273  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872704  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0904  para-aminobenzoate synthase, component I  38.92 
 
 		 594 aa  273  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3496  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.09 
 
 		 599 aa  273  9e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466989  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0939  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.34 
 
 		 591 aa  269  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1528  chorismate binding enzyme  34.01 
 
 		 571 aa  265  2e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0770675  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2819  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.09 
 
 		 599 aa  261  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1683  Para-aminobenzoate synthase, component I  38.37 
 
 		 615 aa  259  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3314  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  37.5 
 
 		 615 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1629  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.76 
 
 		 553 aa  252  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.810406  normal  0.772192 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.08 
 
 		 611 aa  249  1e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.29 
 
 		 615 aa  246  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  31.4 
 
 		 710 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1357  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.47 
 
 		 635 aa  241  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963322  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4435  aminodeoxychorismate synthase  51.62 
 
 		 388 aa  239  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.980894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0817  aminodeoxychorismate synthase  52.16 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.244151  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2474  aminodeoxychorismate synthase  51.09 
 
 		 381 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0362  aminodeoxychorismate synthase  51.08 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.969651 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1011  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  28.55 
 
 		 594 aa  224  6e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00630898  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0984  para-aminobenzoate synthase component I, ADC synthase  29.14 
 
 		 582 aa  222  1.9999999999999999e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3297  aminodeoxychorismate synthase  46.91 
 
 		 386 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  48.04 
 
 		 447 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.75 
 
 		 741 aa  219  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0949  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  28.37 
 
 		 594 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.969894  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0633  aminodeoxychorismate synthase  47.57 
 
 		 398 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0878  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  28.55 
 
 		 594 aa  218  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0178377  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.55 
 
 		 456 aa  216  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31460  aminodeoxychorismate synthase, component I  35.57 
 
 		 587 aa  214  4.9999999999999996e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3598  aminodeoxychorismate synthase  45.82 
 
 		 384 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  45.74 
 
 		 453 aa  213  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0075  aminodeoxychorismate synthase  44.96 
 
 		 389 aa  212  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0080  aminodeoxychorismate synthase  44.6 
 
 		 389 aa  211  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  46.98 
 
 		 447 aa  211  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  46.98 
 
 		 466 aa  210  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0427  para-aminobenzoate synthase component I  34.55 
 
 		 586 aa  210  7e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  46.07 
 
 		 408 aa  209  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.51 
 
 		 480 aa  209  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  40.51 
 
 		 462 aa  209  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4261  aminodeoxychorismate synthase  43.62 
 
 		 386 aa  208  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23160  para-aminobenzoate synthase, component I  46.5 
 
 		 443 aa  207  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.12 
 
 		 458 aa  207  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  44.12 
 
 		 458 aa  206  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1636  para-aminobenzoate synthase component I  44.12 
 
 		 458 aa  206  7e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2729  aminodeoxychorismate synthase  43.67 
 
 		 385 aa  206  9e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  45.23 
 
 		 447 aa  206  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1913  para-aminobenzoate synthase, component I  42.96 
 
 		 509 aa  206  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199301  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.79 
 
 		 509 aa  206  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2685  aminodeoxychorismate synthase  44 
 
 		 385 aa  205  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.627045 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3703  aminodeoxychorismate synthase  42.66 
 
 		 411 aa  205  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.53 
 
 		 467 aa  204  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01782  para-aminobenzoate synthase component I  42.12 
 
 		 453 aa  204  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2040  para-aminobenzoate synthase component I  42.12 
 
 		 453 aa  204  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2073  aminodeoxychorismate synthase  42.12 
 
 		 453 aa  204  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.49 
 
 		 490 aa  204  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>