More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0730 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  100 
 
 
480 aa  966    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  100 
 
 
462 aa  932    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  46.27 
 
 
471 aa  388  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  47.53 
 
 
468 aa  378  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  45.16 
 
 
460 aa  375  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  47.81 
 
 
447 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2225  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.82 
 
 
476 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  44.03 
 
 
458 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.95 
 
 
456 aa  364  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  47.17 
 
 
450 aa  363  3e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  44.27 
 
 
430 aa  362  1e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  46.84 
 
 
453 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  47.61 
 
 
447 aa  361  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  43.52 
 
 
430 aa  361  2e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2208  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.31 
 
 
461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0392675  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  43.36 
 
 
471 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  44.9 
 
 
467 aa  356  5e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.78 
 
 
470 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1346  para-aminobenzoate synthase component I  45.14 
 
 
456 aa  355  1e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  45.17 
 
 
454 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.56 
 
 
470 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.7 
 
 
467 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.24 
 
 
467 aa  353  4e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.89 
 
 
466 aa  352  7e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.03 
 
 
480 aa  352  8.999999999999999e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  45.17 
 
 
454 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1978  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.76 
 
 
474 aa  352  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.306568  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.56 
 
 
470 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.74 
 
 
452 aa  352  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.33 
 
 
470 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  47.38 
 
 
447 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2073  aminodeoxychorismate synthase  44.1 
 
 
453 aa  350  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1902  para-aminobenzoate synthase component I  44.1 
 
 
453 aa  351  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01782  para-aminobenzoate synthase component I  44.1 
 
 
453 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  44.94 
 
 
454 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2040  para-aminobenzoate synthase component I  44.1 
 
 
453 aa  350  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.54 
 
 
467 aa  349  7e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  44.94 
 
 
454 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01770  hypothetical protein  44.34 
 
 
445 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.994837  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1376  aminodeoxychorismate synthase  43.65 
 
 
453 aa  347  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.661176  normal  0.079748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.05 
 
 
447 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  0.0000000000236319 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2541  aminodeoxychorismate synthase  43.88 
 
 
453 aa  347  4e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.169515  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1492  aminodeoxychorismate synthase subunit I  44.72 
 
 
454 aa  347  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2424  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  46.65 
 
 
448 aa  345  7e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.95872  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  41.54 
 
 
453 aa  345  7e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01914  para-aminobenzoate synthase, component I  43.08 
 
 
456 aa  345  8e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  47.7 
 
 
466 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1831  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.65 
 
 
453 aa  345  1e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306293  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.3 
 
 
446 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1821  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.65 
 
 
453 aa  345  1e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.85 
 
 
447 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2381  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.21 
 
 
455 aa  344  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23160  para-aminobenzoate synthase, component I  46.07 
 
 
443 aa  344  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  50.51 
 
 
408 aa  342  7e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.86 
 
 
446 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1627  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.76 
 
 
458 aa  336  5e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.18817  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.7 
 
 
458 aa  336  5.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1636  para-aminobenzoate synthase component I  42.7 
 
 
458 aa  335  7.999999999999999e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  42.7 
 
 
458 aa  335  7.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.59 
 
 
457 aa  333  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0559129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2967  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.67 
 
 
474 aa  329  5.0000000000000004e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0339276 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.52 
 
 
469 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01948  P-aminobenzoate synthetase, component I  40.77 
 
 
476 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0024318  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3614  para-aminobenzoate synthase component I  39.74 
 
 
497 aa  326  6e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.21 
 
 
490 aa  325  9e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2226  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.89 
 
 
467 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  hitchhiker  0.0081347 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1903  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.35 
 
 
477 aa  319  6e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.757454  hitchhiker  0.000298864 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.3 
 
 
466 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2398  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.12 
 
 
457 aa  311  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.48 
 
 
466 aa  310  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2157  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.82 
 
 
473 aa  306  7e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169831  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.57 
 
 
474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1469  hypothetical protein  42.94 
 
 
440 aa  304  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1913  para-aminobenzoate synthase, component I  38.14 
 
 
509 aa  301  2e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199301  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.41 
 
 
464 aa  300  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1514  hypothetical protein  37.67 
 
 
440 aa  299  6e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.58 
 
 
469 aa  298  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0453  para-aminobenzoate synthase, component I  37.58 
 
 
452 aa  298  1e-79  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0249447  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1671  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.61 
 
 
444 aa  298  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  39.62 
 
 
495 aa  297  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.7 
 
 
460 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1094  para-aminobenzoate synthase, component I  38.02 
 
 
448 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0293848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1272  para-aminobenzoate synthase, component I  37.56 
 
 
448 aa  293  5e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3907  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.55 
 
 
472 aa  291  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177197  normal  0.165975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4276  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.67 
 
 
466 aa  290  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1580  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.93 
 
 
449 aa  290  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00938463  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4379  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.14 
 
 
472 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1638  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.34 
 
 
457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1042  anthranilate synthase component I  41.28 
 
 
496 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1334  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.96 
 
 
465 aa  286  8e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  46.01 
 
 
480 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1342  anthranilate synthase, component I  37.53 
 
 
499 aa  278  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00981315  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3258  anthranilate synthase component I-like protein  37.01 
 
 
511 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2497  anthranilate synthase, component I  39.77 
 
 
491 aa  277  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1137  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.45 
 
 
476 aa  273  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.174  normal  0.645122 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1230  anthranilate synthase component I-like protein  43.42 
 
 
484 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.693571  normal  0.438932 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2362  anthranilate synthase component I  36.92 
 
 
495 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.76 
 
 
721 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1766  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.77 
 
 
718 aa  269  7e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0977  p-aminobenzoate synthetase, component I  38.04 
 
 
455 aa  269  7e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000344028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>