More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3010 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  66.16 
 
 		 596 aa  767    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3010  Para-aminobenzoate synthase, component I  100 
 
 		 586 aa  1194    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.173618  normal  0.824102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0607  para-aminobenzoate synthase, subunit I  63.73 
 
 		 574 aa  705    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0332  para-aminobenzoate synthase, subunit I  56.44 
 
 		 573 aa  579  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42564e-18 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.59 
 
 		 592 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0163  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.84 
 
 		 587 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2989  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.07 
 
 		 584 aa  451  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0380  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.37 
 
 		 577 aa  438  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0364924  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2871  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.36 
 
 		 617 aa  434  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872704  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1629  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.94 
 
 		 553 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.810406  normal  0.772192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.14 
 
 		 601 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41 
 
 		 618 aa  368  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3314  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  42.21 
 
 		 615 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.91 
 
 		 611 aa  360  5e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.57 
 
 		 607 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0171  para-aminobenzoate synthase, component I  40.31 
 
 		 612 aa  350  5e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3849  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.74 
 
 		 599 aa  345  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0422  Para-aminobenzoate synthase, component I  39.86 
 
 		 590 aa  343  4e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.744844  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.57 
 
 		 615 aa  339  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.78 
 
 		 710 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.51 
 
 		 629 aa  336  7e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2495  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.46 
 
 		 621 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2835  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.56 
 
 		 599 aa  328  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3087  Para-aminobenzoate synthase, component I  40.03 
 
 		 555 aa  326  8.000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972054  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0723  chorismate binding-like protein  37.27 
 
 		 635 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0445  para-aminobenzoate synthase, component I  36.59 
 
 		 595 aa  324  3e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0270  para-aminobenzoate synthase, component I  37.68 
 
 		 637 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1357  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.29 
 
 		 635 aa  322  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963322  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31460  aminodeoxychorismate synthase, component I  40.53 
 
 		 587 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3062  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.65 
 
 		 630 aa  322  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0754  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.52 
 
 		 637 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0739  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.68 
 
 		 638 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0671  chorismate binding-like protein  37.02 
 
 		 648 aa  319  9e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.08 
 
 		 632 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2633  putative PARA-aminobenzoate synthetase component I protein  39.09 
 
 		 626 aa  318  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1683  Para-aminobenzoate synthase, component I  38.32 
 
 		 615 aa  317  5e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2631  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.98 
 
 		 620 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0904  para-aminobenzoate synthase, component I  40.39 
 
 		 594 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2868  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.83 
 
 		 632 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2920  para-aminobenzoate synthase, component I  39.48 
 
 		 637 aa  313  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3841  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  36.41 
 
 		 644 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0939  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41 
 
 		 591 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3496  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.32 
 
 		 599 aa  311  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466989  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2819  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.16 
 
 		 599 aa  309  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0648  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  36.91 
 
 		 639 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3959  Para-aminobenzoate synthase, component I  37.1 
 
 		 640 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1528  chorismate binding enzyme  34.58 
 
 		 571 aa  303  5.000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0770675  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0809  para-aminobenzoate synthetase component I  35.27 
 
 		 572 aa  300  4e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2783  Para-aminobenzoate synthase, component I  39.6 
 
 		 595 aa  300  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.688281  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1310  chorismate binding enzyme  34.76 
 
 		 669 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255509  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2324  chorismate binding enzyme  34.85 
 
 		 668 aa  297  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2203  para-aminobenzoate synthase, component I  34.85 
 
 		 668 aa  297  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3318  chorismate binding enzyme  34.85 
 
 		 668 aa  297  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1096  chorismate binding enzyme  34.85 
 
 		 668 aa  297  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0503  chorismate binding enzyme  34.85 
 
 		 668 aa  297  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3275  para-aminobenzoate synthase, component I  34.69 
 
 		 668 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.964466  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3308  para-aminobenzoate synthase, component I  34.64 
 
 		 669 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  38.6 
 
 		 623 aa  282  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0427  para-aminobenzoate synthase component I  35.07 
 
 		 586 aa  282  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0651  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.29 
 
 		 629 aa  279  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2844  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.73 
 
 		 673 aa  269  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0929877  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0745  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  34.61 
 
 		 607 aa  256  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.766935  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0984  para-aminobenzoate synthase component I, ADC synthase  28.93 
 
 		 582 aa  254  3e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0878  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  31.62 
 
 		 594 aa  253  5.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0178377  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1011  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  31.89 
 
 		 594 aa  253  6e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00630898  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0949  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  31.89 
 
 		 594 aa  252  1e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.969894  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3297  aminodeoxychorismate synthase  41.62 
 
 		 386 aa  250  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3598  aminodeoxychorismate synthase  41.34 
 
 		 384 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4435  aminodeoxychorismate synthase  42.48 
 
 		 388 aa  243  7.999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.980894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2685  aminodeoxychorismate synthase  41.85 
 
 		 385 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.627045 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4261  aminodeoxychorismate synthase  42.02 
 
 		 386 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0075  aminodeoxychorismate synthase  40.72 
 
 		 389 aa  234  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0080  aminodeoxychorismate synthase  40.44 
 
 		 389 aa  233  6e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0362  aminodeoxychorismate synthase  43.27 
 
 		 390 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.969651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2729  aminodeoxychorismate synthase  41.08 
 
 		 385 aa  233  9e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3703  aminodeoxychorismate synthase  37.01 
 
 		 411 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0633  aminodeoxychorismate synthase  41.79 
 
 		 398 aa  228  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0817  aminodeoxychorismate synthase  42.29 
 
 		 390 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.244151  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2474  aminodeoxychorismate synthase  42.66 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0738  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  33.78 
 
 		 383 aa  218  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0754  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  33.78 
 
 		 383 aa  218  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1913  para-aminobenzoate synthase, component I  43.96 
 
 		 509 aa  217  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199301  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.31 
 
 		 509 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3444  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.21 
 
 		 435 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.716101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.49 
 
 		 466 aa  210  7e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.38 
 
 		 469 aa  208  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.95 
 
 		 456 aa  208  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0066  Anthranilate synthase  42.48 
 
 		 473 aa  208  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.65 
 
 		 452 aa  206  9e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  45.25 
 
 		 408 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1235  Chorismate binding-like protein  35.79 
 
 		 393 aa  206  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  44.61 
 
 		 453 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.7 
 
 		 466 aa  205  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3709  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.32 
 
 		 488 aa  205  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0131027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.62 
 
 		 457 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0559129 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0064  para-aminobenzoate synthase component I  40.23 
 
 		 465 aa  204  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0064  anthranilate synthase  37.67 
 
 		 465 aa  204  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0615  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.77 
 
 		 434 aa  203  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0184347  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.07 
 
 		 467 aa  203  9e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  43.56 
 
 		 467 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>