More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3444 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3444  para-aminobenzoate synthase, subunit I  100 
 
 
435 aa  896    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.716101  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1201  Chorismate binding  47.28 
 
 
417 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.798277  normal  0.539184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7048  Chorismate binding-like protein  43.95 
 
 
412 aa  351  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09868  para-aminobenzoate synthase, component I  42.56 
 
 
430 aa  345  1e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2137  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  42.3 
 
 
428 aa  344  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1808  p-aminobenzoate synthetase, component I  41.78 
 
 
429 aa  310  4e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000581236  normal  0.854034 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39 
 
 
466 aa  242  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  38.65 
 
 
480 aa  242  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.95 
 
 
466 aa  233  6e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  39.5 
 
 
453 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2940  anthranilate synthase component I  36.79 
 
 
471 aa  231  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.256099 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.67 
 
 
611 aa  229  7e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0983  anthranilate synthase component I  34.6 
 
 
474 aa  229  7e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.371518  normal  0.264118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  39.22 
 
 
408 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  38.83 
 
 
468 aa  228  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  36.84 
 
 
495 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.8 
 
 
741 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1869  anthranilate synthase component I  34.71 
 
 
475 aa  226  7e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  38.31 
 
 
454 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0342  anthranilate synthase component I  36.8 
 
 
469 aa  225  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0367738  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1492  aminodeoxychorismate synthase subunit I  38.31 
 
 
454 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  38.31 
 
 
454 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1731  anthranilate synthase component I  34.86 
 
 
491 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.16 
 
 
447 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  38.31 
 
 
454 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2157  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.49 
 
 
473 aa  223  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169831  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  38.03 
 
 
454 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1913  para-aminobenzoate synthase, component I  36.69 
 
 
509 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199301  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0690  Anthranilate synthase  34.68 
 
 
465 aa  223  7e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3258  anthranilate synthase component I-like protein  34.75 
 
 
511 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5650  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.66 
 
 
672 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1366  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.33 
 
 
762 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0518359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.99 
 
 
447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.24 
 
 
446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2225  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.11 
 
 
476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1455  anthranilate synthase component I  41.67 
 
 
514 aa  220  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.686129 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.45 
 
 
629 aa  220  5e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1094  para-aminobenzoate synthase, component I  36.97 
 
 
448 aa  219  5e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0293848  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.59 
 
 
601 aa  219  6e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  34.56 
 
 
460 aa  219  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2547  anthranilate synthase component I  34.6 
 
 
491 aa  219  7e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000521944  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1636  para-aminobenzoate synthase component I  36.99 
 
 
458 aa  219  8.999999999999998e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  36.99 
 
 
458 aa  219  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.99 
 
 
458 aa  219  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.96 
 
 
446 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  36.65 
 
 
430 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1235  Chorismate binding-like protein  35.81 
 
 
393 aa  219  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0064  anthranilate synthase  34.53 
 
 
465 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2156  anthranilate synthase component I  40.94 
 
 
517 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.849379  hitchhiker  0.00323016 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1246  anthranilate synthase component I  33.85 
 
 
492 aa  218  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  36.83 
 
 
430 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0076  para-aminobenzoate synthase, component I  34.93 
 
 
465 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.77 
 
 
447 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  0.0000000000236319 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0310  para-aminobenzoate synthase subunit I  36.75 
 
 
731 aa  218  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.764542  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2497  anthranilate synthase, component I  34.69 
 
 
491 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0064  para-aminobenzoate synthase component I  34.62 
 
 
465 aa  217  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0071  anthranilate synthase  34.01 
 
 
417 aa  217  4e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2073  aminodeoxychorismate synthase  37.96 
 
 
453 aa  217  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01782  para-aminobenzoate synthase component I  37.96 
 
 
453 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1376  aminodeoxychorismate synthase  33.04 
 
 
453 aa  216  5e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.661176  normal  0.079748 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.36 
 
 
469 aa  216  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2115  anthranilate synthase, component I  36.22 
 
 
509 aa  216  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.332687  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2040  para-aminobenzoate synthase component I  37.96 
 
 
453 aa  216  5e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.32 
 
 
509 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.61 
 
 
469 aa  216  5.9999999999999996e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2541  aminodeoxychorismate synthase  33.48 
 
 
453 aa  216  7e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.169515  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5240  para-aminobenzoate synthase, component I  35.54 
 
 
465 aa  216  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1272  para-aminobenzoate synthase, component I  36.41 
 
 
448 aa  216  8e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2584  anthranilate synthase component I  36.24 
 
 
495 aa  216  9e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4120  anthranilate synthase, component I  35.23 
 
 
489 aa  216  9e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1582  anthranilate synthase component I  34.69 
 
 
491 aa  216  9e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000405168  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1580  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.06 
 
 
449 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00938463  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.64 
 
 
466 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1831  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.68 
 
 
453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306293  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0067  para-aminobenzoate synthase component I  34.65 
 
 
480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  36.13 
 
 
467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  36.13 
 
 
447 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1821  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.68 
 
 
453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.77 
 
 
710 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1162  anthranilate synthase component I  34.76 
 
 
485 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  35.77 
 
 
467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2383  anthranilate synthase component I  34.15 
 
 
491 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1902  para-aminobenzoate synthase component I  37.68 
 
 
453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0615  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.37 
 
 
434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0184347  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.52 
 
 
607 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.7 
 
 
480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0730  anthranilate synthase, component I  34.42 
 
 
494 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.31 
 
 
470 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  36.93 
 
 
453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0148  anthranilate synthase component I  35.9 
 
 
501 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0080  para-aminobenzoate synthase, component I  34.27 
 
 
465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0077  para-aminobenzoate synthase, component I  34.45 
 
 
465 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000409192 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3245  anthranilate synthase component I  36.46 
 
 
505 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.459901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2846  anthranilate synthase component I  36.46 
 
 
505 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361965  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0248  anthranilate synthase component I  34.4 
 
 
507 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0068  para-aminobenzoate synthase component I  34.45 
 
 
465 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0064  para-aminobenzoate synthase component I  34.45 
 
 
465 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0064  para-aminobenzoate synthase component I  34.45 
 
 
465 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01770  hypothetical protein  37.86 
 
 
445 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.994837  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0068  para-aminobenzoate synthase component I  34.45 
 
 
465 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>